2022–2023年越南北部的猪流行性腹泻病毒：发现一种新的亚基因组（G2e）在猪群中出现

《Veterinary Research Communications》：Porcine epidemic diarrhea viruses (2022–2023) in Northern Vietnam: revealing a new subgenogroup (G2e) to emerge in pigs

越南中部和北部六省发现2022-2023年新型PEDV亚群G2e，含九个独特氨基酸位点，与广西PEDV遗传关联，显著区别于G1a-g1d和G3等典型亚群，促进对PEDV多样性及越南复杂共循环和进化的理解。

　　

摘要

我们提供了证据，支持在越南中部和北部的六个省份中识别出一种新兴的猪流行性腹泻病毒（PEDV）亚基因组（2022–2023年）。该亚基因组被命名为新的G2e亚基因组。该亚基因组包含九个具有独特氨基酸变异的位点，在系统发育上与先前识别的亚基因组不同。这些病毒在基因上与中国广西地区的PEDV毒株相关，这表明它们可能具有共同的起源。估计这些病毒与典型亚基因型（G1a、G1b、G1c、G1d、G2a、G2b、G2c、G2d和G3）之间的平均遗传距离具有显著性，从而将其与其他亚基因组明显区分开来。我们的发现有助于更好地理解PEDV的多样性，特别是2010年代出现的G2亚基因组病毒株，以及越南境内多种（亚）基因型病毒株的复杂共循环和进化过程。