通过计算方法发现乙基没食子酸作为一种新型的Toll相互作用蛋白(TOLLIP)结合物:针对百草枯诱导的毒性的治疗策略

《In Silico Pharmacology》:Computational discovery of Ethyl gallate as a novel toll-interacting-protein (TOLLIP) interactor: a therapeutic strategy against paraquat-induced toxicity

【字体: 时间:2025年11月07日 来源:In Silico Pharmacology

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  通过分子对接、MM/GBSA和ADME-Tox筛选89种植物成分,发现乙基肉桂酸-TooLIP复合物具有最佳结合自由能(-8.94 kcal/mol)和结构稳定性,为帕拉喹啉中毒治疗提供新靶点。

  

摘要

百草枯(PQ)是一种高毒性的除草剂,对人类具有致命性,并会导致多器官毒性,因为目前尚无有效的治疗方法。尽管针对新的治疗靶点和先导化合物进行了大量研究,但现有的治疗百草枯引起的毒性的方法仍然不足且具有挑战性,这突显了开发具有重大意义的治愈性治疗方法的迫切需求。本研究采用计算方法来识别具有与Toll相互作用蛋白(TOLLIP)潜在结合亲和力的植物成分抗氧化剂。首先,通过分子对接、基于力学原理的Born表面面积(MM/GBSA)结合能计算以及ADME-Tox(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)分析,评估了89种植物成分与TOLLIP的结合亲和力。其中,熊果苷、香豆酸、没食子酸、阿魏酸和香草酸这五种化合物不仅表现出显著的结合亲和力,还具有良好的药代动力学特性,随后进一步进行了分子动力学模拟、轨迹分析(RMSD、RMSF、回转半径)、结合自由能以及PCA和DCCM等分析。我们的全面计算分析表明,没食子酸-TOLLIP复合物是一个有前景的候选物质,其特点是结构稳定性极佳、波动最小且结合自由能为负值最高。因此,没食子酸可能通过靶向TOLLIP成为缓解百草枯毒性的一种有效治疗剂。

百草枯(PQ)是一种高毒性的除草剂,对人类具有致命性,并会导致多器官毒性,因为目前尚无有效的治疗方法。尽管针对新的治疗靶点和先导化合物进行了大量研究,但现有的治疗百草枯引起的毒性的方法仍然不足且具有挑战性,这突显了开发具有重大意义的治愈性治疗方法的迫切需求。本研究采用计算方法来识别具有与Toll相互作用蛋白(TOLLIP)潜在结合亲和力的植物成分抗氧化剂。首先,通过分子对接、基于力学原理的Born表面面积(MM/GBSA)结合能计算以及ADME-Tox(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)分析,评估了89种植物成分与TOLLIP的结合亲和力。其中,熊果苷、香豆酸、没食子酸、阿魏酸和香草酸这五种化合物不仅表现出显著的结合亲和力,还具有良好的药代动力学特性,随后进一步进行了分子动力学模拟、轨迹分析(RMSD、RMSF、回转半径)、结合自由能以及PCA和DCCM等分析。我们的全面计算分析表明,没食子酸-TOLLIP复合物是一个有前景的候选物质,其特点是结构稳定性极佳、波动最小且结合自由能为负值最高。因此,没食子酸可能通过靶向TOLLIP成为缓解百草枯毒性的一种有效治疗剂。

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