核酸代谢对三阴性乳腺癌预后及免疫侵袭的影响

《Genes & Immunity》：Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer

本研究揭示核苷酸代谢相关基因（NAMRGs）在TNBC中影响分子亚型、临床病理特征及预后，构建NAM_model预测模型，发现PDE8B促进EMT和转移，并关联化疗靶向敏感性及TME免疫耗竭。

　　

摘要

核酸代谢过程受到多种致癌因素的驱动，为肿瘤细胞的恶性表型提供了物质基础和能量保障。然而，核酸代谢在 triple-negative breast cancer (TNBC) 发展中的作用仍不明确。在此研究中，我们分析了来自三个数据集的 297 个 TNBC 样本转录组中与核酸代谢相关的基因 (NAMRGs) 的表达模式。我们使用单细胞 RNA 测序分析以及体内和体外实验来验证 NAMRGs 与肿瘤转移及肿瘤免疫微环境 (TME) 特征之间的相关性。根据研究结果，我们识别出两种不同的分子亚型，并建立了这些分子亚型与四种遗传亚型和四种病理亚型之间的关系。核酸代谢的变化与同源重组修复缺陷 (HRD) 的变化、细胞在 TME 中的浸润以及患者的预后相关。我们还构建了一个预测模型 NAM_model，该模型纳入了四个 NAMRGs (DPYD、PDE6G、PDE8B 和 TYMS)，并将其与其他临床指标相结合。该模型具有很高的预测准确性，表明高风险患者的预后较差，且 NAMRGs 与 TME 免疫耗竭有关。此外，NAMRGs 与化疗和靶向治疗的药物敏感性也存在显著相关性。体内和体外研究表明，PDE8B 是一种促肿瘤生长的致癌基因，它通过促进上皮-间质转化 (EMT) 诱导 TNBC 转移，这一现象此前尚未被报道。单细胞 RNA 测序还揭示了核酸代谢和 HRD 对耗竭的 CD8⁺ T 细胞的独特影响。对 NAMRGs 的全面分析揭示了核酸代谢介导的机制（如 HRD 和 EMT）对 TNBC 患者的临床病理特征、TME 特征和预后的潜在影响。这些发现加深了我们对 NAMRGs 在 TNBC 和免疫治疗中作用的理解，将极大地有助于患者的分层管理和个性化临床决策。