综述:从发现到临床应用:骆驼科动物来源的单域抗体的结构特性、工程化改造方案及其在临床和“下一代”医疗技术中的应用
《mAbs》:From discovery to the clinic: structural insights, engineering options, clinical, and ‘next wave’ applications of camelid-derived single-domain antibodies
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时间:2025年11月07日
来源:mAbs 7.3
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单域抗体(sdAbs)源于骆驼等动物,具有小分子量、高稳定性和多功能集成优势。截至2025年10月,已有五种基于sdAbs的疗法获批,如caplacizumab和envafolimab。文章综述了sdAbs的结构特征(如CDR3多样性、非经典二硫键)、生成技术(免疫camelids、合成库、AI设计)、临床应用(靶向TNF、PD-L1等)及未来方向(口服递送、allosteric调节)。
近年来,单域抗体(sdAbs)作为一种从骆驼科动物中提取的特殊抗体片段,正逐渐成为构建治疗性分子的重要组成部分。这些抗体的单域结构,如VHH(重链抗体的可变域),因其独特的特性,在治疗领域展现出巨大的潜力。截至2025年10月,全球已有五种基于VHH的治疗性分子获得市场准入,这一进展表明了其在药物开发中的重要性。VHH具有类似传统抗体的亲和力和特异性,同时具备良好的稳定性以及较小的分子量,使其能够作为独立的结合区域(paratopes)使用。此外,由于VHH不依赖轻链的参与,它们为构建双特异性或多功能抗体提供了多种工程化可能性。
VHH的结构特征决定了其在治疗中的优势。与传统IgG抗体不同,VHH仅由一个可变域构成,这使得其在设计时具有更高的灵活性。结构分析表明,VHH的框架区域(FR2)包含一些标志性残基,这些残基在缺乏轻链的情况下仍能保持结合区域的稳定性和可溶性。这些标志性残基在三维结构中暴露于溶剂中,可以直接与抗原相互作用,或者稳定CDR3(互补决定区3)的构象。此外,VHH还经常包含非经典的二硫键,这些二硫键能够进一步稳定结合区域,减少构象熵,并扩大其结合能力的多样性。这些结构特性使得VHH在药物开发中具有独特的优势,例如更高的热稳定性、更低的聚集倾向以及更易进行人类化改造。
VHH的产生方式多种多样,包括通过免疫骆驼科动物、转基因动物以及合成或半合成库的筛选。在免疫骆驼科动物的方法中,通常采用多次抗原注射,如使用小鼠、骆驼、羊驼和双峰骆驼等,通过提取外周血单核细胞(PBMC)的RNA,利用PCR技术扩增VHH序列,进而构建噬菌体或酵母展示库。这一过程通常在6至12周内完成,并通过多轮筛选获得针对特定抗原的高亲和力VHH。相比之下,转基因动物方法则通过基因编辑技术,将VHH基因整合到宿主动物的免疫系统中,使其能够产生具有人类特征的单域抗体。这种方法在开发过程中展现出更高的效率,同时减少了对动物的依赖性。
随着生物技术的发展,人工智能和机器学习(AI/ML)也被广泛应用于VHH的设计和优化。例如,Erasmus等人提出了一种半合成/半免疫的策略,利用酵母表面展示技术对VHH进行筛选,并通过计算方法优化其亲和力和可开发性。而Mille-Fragoso等人开发的“Germinal”框架则结合了AlphaFold-Multimer和抗体特异性语言模型(IgLM),以实现结构和序列的协同优化。这些方法不仅提高了VHH设计的效率,还增强了其在不同治疗场景中的适用性。
在VHH的临床应用中,其结构和功能特性决定了其在不同药物格式中的表现。例如,已批准的VHH治疗性分子包括单特异性、双特异性、多特异性以及结合Fc或人血清白蛋白(HSA)的构型。这些不同的药物格式允许VHH在不同治疗目标中发挥作用,如延长半衰期、提高结合亲和力或增强靶向性。通过将VHH与Fc区域融合,可以利用新生儿Fc受体(FcRn)实现半衰期的延长,而结合HSA则提供了类似的机制。此外,VHH还可以作为CAR-T细胞疗法的抗原识别模块,如ciltacabtagene autoleucel,这是一种针对B细胞成熟抗原(BCMA)的双结合位点VHH结构,被批准用于治疗复发/难治性多发性骨髓瘤。
在VHH的开发过程中,对其结构特性的分析至关重要。通过对49种进入临床研究的VHH序列进行计算机模拟分析,可以进一步优化其可开发性。这些分析包括对序列相似性、非经典半胱氨酸的识别、可能的糖基化位点以及等电点(pI)的计算。结果显示,这些VHH序列在人类化程度、稳定性以及结合能力方面表现出不同的特性。例如,一些VHH来源于转基因动物平台,其人类化程度较高,而另一些则具有较低的亲和力,但经过优化后可以达到理想的治疗效果。这些数据为未来的VHH治疗性分子开发提供了重要的参考。
VHH的结构和功能特性不仅影响其在治疗中的表现,还决定了其在不同药物格式中的应用。例如,VHH可以作为单域结合区,用于构建双特异性抗体,或者与其他结合区域组合,形成多特异性或多功能的抗体。此外,VHH还可以通过与Fc区域或HSA结合,延长其在体内的停留时间,从而提高治疗效果。这种灵活性使得VHH成为抗体工程领域的重要工具,适用于多种治疗场景,包括癌症、自身免疫疾病和病毒感染等。
除了作为药物开发的工具,VHH还在基础研究中展现出重要价值。它们被广泛用于结构生物学研究,如稳定G蛋白偶联受体(GPCR)在特定构象状态下的结构,从而揭示其功能机制。此外,VHH还被用于调控蛋白质活性,例如作为配体的替代品或辅助因子,影响受体的信号传导。这种多功能性使得VHH在药物开发和基础研究中都具有广阔的应用前景。
在药物开发过程中,VHH的工程化改造和优化是确保其临床可行性的关键步骤。例如,通过保留关键的标志性残基并进行合理的序列调整,可以提高VHH的亲和力和特异性。同时,针对不同治疗目标的药物格式,如双特异性、多特异性和多价结构,都需要对VHH进行适当的修饰和设计。这些优化措施不仅提高了VHH的治疗效果,还减少了其潜在的免疫原性和不良反应。
随着对VHH结构和功能的深入研究,越来越多的创新药物格式正在被开发。例如,一些研究团队正在探索VHH作为细胞因子模拟物(mimetics)的潜力,通过靶向特定的细胞因子受体,实现对免疫反应的精准调控。此外,VHH还被用于开发新型的免疫调节策略,如通过靶向不同的细胞因子受体,触发特定的信号通路,从而实现对免疫细胞功能的增强或抑制。这些研究为未来的免疫治疗提供了新的思路。
在实际应用中,VHH的稳定性是其成为治疗性分子的重要因素之一。由于其较小的分子量和结构特点,VHH在体内具有良好的稳定性,同时减少了聚集倾向。此外,通过优化其序列和构型,可以进一步提高其在不同环境中的适应性,如胃肠道环境。这使得VHH在口服给药方面展现出独特的优势,如针对胃肠道病原体或自身免疫性疾病的治疗。然而,保持VHH在胃肠道中的功能活性仍然是一个挑战,需要进一步研究其在极端pH、高温和蛋白酶环境下的稳定性。
VHH的未来发展不仅依赖于其在药物开发中的应用,还涉及到其在多种生物技术平台中的整合。例如,通过将VHH与其他分子结合,如细胞因子或毒素,可以实现更复杂的治疗策略。此外,利用AI/ML技术对VHH进行设计和优化,可以加速其发现过程,并提高其在不同治疗场景中的适用性。这些技术的应用使得VHH成为抗体工程领域的重要工具,为未来的治疗性分子开发提供了新的方向。
综上所述,VHH作为一种独特的抗体片段,具有广泛的应用前景。其结构和功能特性使其在多种治疗性分子中发挥重要作用,同时为抗体工程提供了丰富的设计空间。随着技术的不断进步,VHH在药物开发中的角色将愈发重要,成为治疗领域的重要组成部分。未来的研究将继续探索VHH在不同治疗场景中的潜力,并进一步优化其结构和功能,以实现更高效的治疗效果。
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