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在布法罗皮肤组织中鉴定最稳定表达的内部控制基因,以用于目标基因表达的标准化
《Environmental and Molecular Mutagenesis》:Identification of Most Stably Expressed Internal Control Genes for Normalization of Target Gene Expression in Buffalo Skin Tissue
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年11月08日 来源:Environmental and Molecular Mutagenesis 2.3
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水牛皮肤黑色素合成相关基因表达稳定性分析发现GAPDH、EEF1A1和RPS23组合最稳定,验证显示该组合能有效归一化黑与白皮肤样本中KIT和TYR基因表达差异,为热适应相关研究提供可靠内参依据。
水牛(Bubalus bubalis)的皮肤与其他家养牛类相比,具有独特的形态和生理适应性,这得益于其皮肤中丰富的黑色素,有助于更好地调节体温。黑色素的合成和分布受黑色素生成途径及相关基因的控制,这些因素决定了毛色表型并影响耐热性。目前,关于水牛皮肤色素沉着的分子机制以及用于 qPCR 标准化的可靠内参基因(ICGs)的研究仍较为有限。本研究通过系统评估九个候选参考基因在色素差异明显的水牛皮肤组织中的表达稳定性,填补了这一研究空白——具体来说,研究了纯黑色穆拉水牛(Murrah)和尼利拉维水牛(Nili Ravi,CC1)与斑点较多的尼利拉维水牛(Nili Ravi,CC2)之间的差异。通过应用多种统计算法(deltaCq、NormFinder、geNorm、BestKeeper),发现 GAPDH、EEF1A1 和 RPS23 这三个基因的组合是最稳定的参考基因集,适用于表达数据标准化。使用关键黑色素生成相关基因(KIT 和 TYR)进行验证后,证实使用该组合进行标准化能够获得一致且生物学上具有意义的表达谱;其中,KIT 在黑色皮肤中的表达显著下调。推荐的参考基因组合可确保在水牛皮肤组织中对黑色素生成相关基因的表达分析具有较高的准确性。
作者声明不存在利益冲突。
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