发现XRF-1021(一种2,4-二取代-5-氟嘧啶衍生物)作为同源结构域相互作用蛋白激酶2抑制剂,可用于治疗慢性肾病

《European Journal of Medicinal Chemistry》:Discovery of XRF-1021, a 2,4-Disubstituted-5-Fluoro-Pyrimidine Derivative as Homeodomain-Interacting Protein Kinase 2 Inhibitors for the Treatment of Chronic Kidney Disease

【字体: 时间:2025年11月08日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 5.9

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  慢性肾病纤维化治疗新策略:基于HIPK2抑制的2,4-取代-5-氟嘧啶衍生物设计与验证。通过结构修饰优化前导化合物15q,合成系列化合物并筛选出高效抑制剂XRF-1021(IC50=0.18 μM)。体外实验证实其抑制TGF-β/NF-κB/p53信号通路,显著降低Fibronectin、Collagen I和α-SMA表达。体内模型(腺嘌呤饮食、UUO)显示XRF-1021改善肾功能,减少肾间质纤维化,LD50达1943 mg/kg,NOAEL为269 mg/kg,为靶向HIPK2治疗慢性肾病提供候选药物。

  慢性肾病(Chronic Kidney Disease, CKD)是一种全球范围内广泛存在的疾病,其发病率高达10%-13%。该疾病的特点是持续性的炎症反应和肾脏纤维化,主要由高血压、慢性肾小球肾炎和多囊肾病等病理因素引发。尽管目前已有部分药物用于CKD的治疗,如Finerenone和Dapagliflozin,但它们在临床应用中仍存在一定的局限性,包括副作用和疗效不足等问题。因此,开发更安全、有效的治疗药物仍然是一个迫切的需求。

在众多潜在的治疗靶点中,Homeodomain-interacting protein kinase 2(HIPK2)被认为是一个极具前景的分子。HIPK2是一种核内的双重特异性丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸激酶,它在调控纤维化和炎症过程中发挥着重要作用。已有研究表明,HIPK2通过调节多个关键的信号通路,如NF-κB、TGF-β/Smad3、p53和Wnt/β-catenin等,参与了纤维化相关生物学效应的产生。在多种肾纤维化模型和CKD患者的组织样本中,HIPK2的表达水平均显著升高,这进一步支持了其作为治疗靶点的潜力。

为了进一步提高针对HIPK2的化合物的抑制活性,研究人员基于已有的结构研究,对15q这一先导化合物进行了结构修饰。15q是通过将TAE-226的2-氨基苯并酰胺结构环化为苯并咪唑核心而得到的化合物,它在体外和体内实验中均显示出对HIPK2的高效抑制作用。通过一系列的化学合成路径,研究人员设计并合成了多个2,4-二取代-5-氟嘧啶衍生物,其中化合物7a(XRF-1021)表现出了最显著的HIPK2抑制活性,其IC50值为0.18 μM。这一数值表明XRF-1021在抑制HIPK2方面具有极高的效力。

在体外实验中,XRF-1021被证明能够显著降低TGF-β1刺激下的NRK-49F和HK-2细胞中纤维化标志物的表达,包括纤维连接蛋白(Fibronectin)、胶原蛋白I(Collagen I)和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)。这些标志物是肾脏纤维化过程中的关键指标,它们的表达水平与纤维化进程密切相关。XRF-1021的抑制作用表明,它可能通过干扰HIPK2的活性,进而阻断纤维化相关信号通路的传导,从而减轻肾脏组织的损伤。

在体内实验中,XRF-1021被测试在0.2%腺嘌呤饮食模型和单侧输尿管梗阻(Unilateral Ureteral Obstruction, UUO)模型中的效果。结果表明,XRF-1021显著改善了肾功能,减少了肾小管损伤和胶原沉积。这一发现进一步验证了XRF-1021在抗纤维化治疗中的潜力。在腺嘌呤模型中,XRF-1021的半数致死量(LD50)为1943 mg/kg,而在UUO模型中,其无观察到有害效应的剂量(NOAEL)为269.0 mg/kg,这说明该化合物具有一定的安全性和耐受性,为后续的临床研究提供了基础。

除了对HIPK2的直接抑制作用外,XRF-1021还表现出对TGF-β、NF-κB和p53等信号通路的显著抑制效果。这些通路在肾脏纤维化和炎症反应中扮演着核心角色,它们的异常激活会导致细胞外基质的过度沉积和组织结构的破坏。XRF-1021通过抑制这些通路,能够有效阻断纤维化过程中的关键步骤,从而减轻肾脏损伤。此外,已有研究指出,HIPK2的C端结构域能够抑制NF-κB的活性,这可能意味着XRF-1021的作用机制不仅限于直接抑制HIPK2,还可能通过影响其与其他蛋白的相互作用,进一步发挥抗炎和抗纤维化的效果。

为了确保化合物的合成质量,研究人员采用了多种化学方法进行合成,并通过薄层色谱(TLC)和硅胶柱色谱对反应进程和产物纯度进行了监控和优化。最终,所有合成的化合物均通过高效液相色谱(HPLC)验证其纯度超过95%。这种高纯度的化合物不仅保证了实验的可靠性,也为后续的药理学研究和临床应用提供了坚实的基础。

在结构-活性关系(Structure-Activity Relationship, SAR)研究中,研究人员对2,4-二取代-5-氟嘧啶衍生物的结构进行了系统分析。结果显示,将N-2位置的取代基替换为不同的芳香基团,如2-氨基苯并咪唑,能够显著提高化合物对HIPK2的抑制活性。这表明,取代基的种类和位置对化合物的生物活性具有重要影响。此外,通过保留嘧啶环和哌嗪环的核心结构,并对N-4位置进行直接连接,研究人员成功优化了化合物的分子构型,使其更有利于与HIPK2的结合,从而提高其抑制效果。

在药物开发过程中,分子对接(Molecular Docking)、分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulations)、药物亲和响应靶点稳定性(Drug Affinity Responsive Target Stability, DARTS)以及基于细胞的机制研究和体内药物可行性研究均被采用。这些研究方法不仅帮助研究人员理解XRF-1021与HIPK2之间的相互作用机制,还评估了其在体内的稳定性和生物利用度。结果显示,XRF-1021在体内外均表现出良好的药物特性,为将其发展为针对HIPK2的抗纤维化药物提供了有力支持。

XRF-1021的发现不仅为CKD的治疗提供了新的思路,也为相关疾病的药物研发开辟了新的方向。由于HIPK2在多种慢性炎症和纤维化疾病中的普遍表达,XRF-1021的抗纤维化作用可能不仅限于肾脏疾病,还可能适用于其他类型的纤维化疾病,如肺纤维化、肝纤维化和心脏纤维化等。这使得XRF-1021具有更广泛的临床应用前景。

从药理学角度来看,XRF-1021的高效性和安全性使其成为一种极具潜力的候选药物。它能够通过多种机制干预纤维化过程,包括直接抑制HIPK2的活性、阻断相关信号通路的传导以及促进细胞外基质的降解。这些作用机制的多样性可能有助于提高其在临床中的疗效,减少耐药性的发生。

此外,XRF-1021的结构特点也为进一步的药物优化提供了可能。通过调整取代基的种类和位置,研究人员可以探索更多具有类似或更优抑制效果的化合物。这不仅有助于提高药物的效力,还可能优化其药代动力学特性,如生物利用度、半衰期和组织分布等,从而提高其临床应用价值。

综上所述,XRF-1021作为HIPK2的高效抑制剂,具有显著的抗纤维化和抗炎作用。它在体外和体内实验中均表现出良好的疗效和安全性,为CKD的治疗提供了新的可能性。未来的研究可以进一步探讨XRF-1021在不同纤维化疾病中的应用,并通过临床试验验证其实际疗效。这一研究不仅推动了HIPK2作为治疗靶点的深入探索,也为慢性肾病及其他纤维化相关疾病的治疗带来了新的希望。
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