综述:分子生物标志物在开发针对中枢神经系统肿瘤的靶向治疗中的转化作用

《IBRO Neuroscience Reports》:Translational Role of Molecular Biomarkers in Developing Targeted Therapies for Central Nervous System Tumors

【字体: 时间:2025年11月08日 来源:IBRO Neuroscience Reports 2.9

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  生物标志物在CNS肿瘤精准诊疗中的应用进展,系统综述了MGMT甲基化、IDH1/2突变等核心生物标志物的临床价值及检测方法,分析了液态活检技术(ctDNA、miRNA、外泌体等)在诊断、预后评估和治疗监测中的潜力与局限性,并探讨了多组学整合与AI辅助的展望,指出标准化检测流程和资源可及性是未来关键挑战。

  ### 中枢神经系统肿瘤生物标志物的识别与靶向治疗策略的进展

中枢神经系统(CNS)肿瘤是医学领域中的一个重要挑战,因其复杂的生物学特性、难以治疗的特性以及对患者生活质量的深远影响。这类肿瘤包括脑肿瘤和脊髓肿瘤,其中脑肿瘤尤其常见,例如胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM),它占据了成人恶性脑肿瘤的大部分病例,且即使在综合治疗下,中位生存期也仅为12至15个月。CNS肿瘤的诊断和治疗长期以来依赖于传统的组织活检和手术切除,但这些方法不仅侵入性强,而且存在一定的局限性。因此,近年来,随着分子生物学和生物技术的快速发展,生物标志物的识别和应用成为推动精准医学和靶向治疗策略的重要方向。

生物标志物的发现为CNS肿瘤的分类、预后评估和治疗反应提供了更精确的依据。这些标志物通常来源于肿瘤细胞的遗传变异、表观遗传变化或代谢产物,如DNA修复酶的失活、受体酪氨酸激酶信号通路的异常激活、代谢通路的改变等。其中,一些标志物已被广泛应用于临床,如MGMT启动子甲基化、IDH1/2突变、H3K27M突变等。这些标志物不仅帮助医生在诊断阶段更好地分类肿瘤,还能指导治疗方案的选择,从而提高患者的生存率和生活质量。

在CNS肿瘤的研究中,液态活检(liquid biopsy)技术的应用正在逐步改变传统的诊断和监测方式。液态活检通过检测血液、脑脊液等体液中的肿瘤相关分子标志物,如循环肿瘤细胞(CTCs)、循环肿瘤DNA(ctDNA)、循环miRNA、细胞外囊泡(EVs)和循环蛋白等,提供了一种微创、非侵入性的检测手段。这种方法不仅可以帮助识别最小残留病灶,还能动态监测治疗反应和肿瘤进展,从而实现对疾病过程的实时追踪。然而,液态活检在CNS肿瘤中的应用仍面临诸多挑战,如血脑屏障对药物和分子的限制、标志物的异质性、检测技术的标准化问题等。

在临床应用方面,生物标志物的检测已被广泛纳入诊断流程。例如,MGMT启动子甲基化已成为胶质母细胞瘤治疗决策的重要依据,因为它与替莫唑胺(TMZ)化疗的敏感性密切相关。此外,IDH1/2突变也被用于区分低级别胶质瘤和高级别胶质母细胞瘤,并与更好的预后相关。然而,这些标志物在不同机构之间的检测方法和结果解读存在差异,这在一定程度上影响了其在临床实践中的推广和应用。因此,建立统一的检测标准和验证流程成为未来研究的重要方向。

### 分子标志物的发现与验证

分子标志物的发现和验证是推动CNS肿瘤精准治疗的关键环节。例如,MGMT启动子甲基化是目前最被广泛认可的预测性标志物之一。MGMT基因编码一种DNA修复酶,能够去除DNA中O6位的烷基化修饰。在胶质母细胞瘤中,MGMT启动子的甲基化会抑制该基因的表达,导致细胞对TMZ的敏感性增加,从而提高患者的总体生存率。在临床实践中,MGMT甲基化状态已被用于指导胶质母细胞瘤患者的治疗选择,特别是在决定是否使用TMZ化疗时。

IDH1和IDH2(异柠檬酸脱氢酶)突变则是低级别胶质瘤和继发性胶质母细胞瘤的重要特征。这些突变导致D-2-羟基戊二酸(D-2HG)的产生,这种代谢产物能够诱导DNA和组蛋白的广泛甲基化,改变细胞的表观遗传状态。IDH突变的胶质瘤通常表现出更好的预后,并对放化疗更敏感。因此,IDH1/2突变已被纳入WHO对CNS肿瘤的分类体系中,成为诊断和治疗的重要依据。

除了IDH突变,1p/19q共缺失也是寡切片胶质瘤(oligodendroglioma)的重要标志物。这种基因缺失通常与更好的预后和对化疗的敏感性相关,因此在诊断过程中具有重要价值。同样,H3K27M突变是弥漫性中线胶质瘤(diffuse midline glioma)的标志性特征,能够帮助医生更准确地判断肿瘤的类型和分级。

TERT启动子突变在胶质母细胞瘤和寡切片胶质瘤中也较为常见,它与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。TERT基因编码端粒酶逆转录酶,其突变能够激活端粒酶活性,促进细胞的无限增殖能力。因此,TERT突变被认为是胶质瘤进展的重要预测指标。

EGFR(表皮生长因子受体)的扩增或突变在胶质母细胞瘤中也较为常见,其突变形式EGFRvIII则表现出持续的活性,且不受配体调控。这种突变通常与肿瘤的侵袭性和不良预后相关,尽管EGFR靶向治疗在临床试验中表现出一定的潜力,但其在实际应用中的效果仍受到肿瘤异质性的影响。

### 循环肿瘤细胞(CTCs)与液态活检

循环肿瘤细胞(CTCs)是近年来在CNS肿瘤研究中备受关注的生物标志物之一。CTCs是指从原发或转移性肿瘤脱落并进入血液、脑脊液等体液中的恶性细胞。它们在肿瘤转移过程中起着关键作用,能够反映肿瘤的侵袭性。尽管传统的血脑屏障限制了CTCs在CNS肿瘤中的广泛存在,但近年来的研究发现,胶质母细胞瘤患者在血液中仍可检测到CTCs。这种发现为通过液态活检进行肿瘤监测提供了新的思路。

CTCs的检测通常依赖于EpCAM(上皮细胞黏附分子)为基础的富集方法,但这种方法对于胶质母细胞瘤的检测效果有限,因为这类肿瘤细胞通常不表达EpCAM。因此,研究者正在探索基于其他分子标志物的检测方法,如利用telomerase(端粒酶)或肿瘤特异性基因标记物进行CTCs的识别。此外,CTCs的分子特征,如EGFR扩增或突变,可以提供关于肿瘤生物学特性的重要信息,有助于预测治疗反应和疾病进展。

尽管CTCs在CNS肿瘤中的检测具有重要价值,但其临床应用仍面临诸多挑战。首先,CTCs的丰度较低,检测方法需要具备更高的灵敏度和特异性。其次,CTCs的异质性使得其检测结果可能不具代表性,需要结合其他生物标志物进行综合分析。此外,CTCs的检测还受到样本处理和储存条件的影响,因此标准化的检测流程和样本处理技术对于确保结果的可靠性和可重复性至关重要。

### 循环肿瘤DNA(ctDNA)与基因组学研究

循环肿瘤DNA(ctDNA)是另一种重要的液态活检标志物,它来源于肿瘤细胞的凋亡或坏死,并释放到血液或脑脊液中。与正常细胞释放的cfDNA(细胞游离DNA)相比,ctDNA通常具有更短的片段长度,并携带肿瘤特异性基因突变。然而,在CNS肿瘤中,由于血脑屏障的存在,ctDNA的释放受到限制,导致其在血液中的浓度较低。因此,研究者更倾向于在脑脊液中进行ctDNA的检测,以提高其敏感性和准确性。

ctDNA的检测技术包括数字PCR、下一代测序(NGS)和超深度测序。这些技术能够识别低频突变,并用于监测治疗反应和早期复发。例如,ctDNA的动态变化可以作为肿瘤进展的替代指标,帮助医生评估治疗效果和调整治疗方案。此外,ctDNA的检测还能够揭示肿瘤的基因组异质性,为个性化治疗提供更全面的信息。

然而,ctDNA的检测仍面临一些挑战。首先,其检测的灵敏度和特异性取决于所使用的分析平台和技术,因此需要进一步优化。其次,ctDNA的检测结果可能受到多种因素的影响,如样本处理、储存条件和检测方法的标准化问题。因此,建立统一的检测标准和验证流程对于推动ctDNA在临床中的应用至关重要。

### 循环miRNA与肿瘤生物学

循环miRNA(microRNA)是近年来在CNS肿瘤研究中受到关注的另一类生物标志物。miRNA是一类小分子非编码RNA,能够通过调控基因表达来影响细胞的增殖、分化和凋亡。在CNS肿瘤中,miRNA的表达模式通常与肿瘤的类型和分级相关,因此具有重要的诊断和预后价值。

例如,miR-21在胶质母细胞瘤中表现出显著的高表达,它能够通过抑制凋亡相关基因的表达来促进肿瘤的生长。实验研究表明,miR-21的沉默能够有效抑制肿瘤细胞的增殖并促进细胞凋亡。此外,miR-21的表达水平还与患者的总体生存率相关,因此它被广泛用作诊断和预后标志物。

除了miR-21,其他miRNA如miR-185、miR-125b、miR-128、miR-485-3p和miR-342-3p也被研究发现与CNS肿瘤相关。这些miRNA的表达水平可以反映肿瘤的生物学特性,并用于指导治疗方案的选择。例如,miR-125b的低表达可能与胶质母细胞瘤的诊断相关,而miR-128、miR-485-3p和miR-342-3p的减少则可能与肿瘤的分级和治疗反应有关。

miRNA的检测方法包括定量逆转录PCR(qRT-PCR)、测序和微阵列技术。这些方法能够提供关于miRNA表达水平的详细信息,有助于肿瘤的早期检测和动态监测。然而,miRNA的检测仍面临一些挑战,如样本的标准化处理、miRNA的稳定性以及其与其他生物标志物的协同作用等。因此,未来的研究需要进一步探索miRNA在CNS肿瘤中的作用,并将其整合到更全面的生物标志物检测体系中。

### 细胞外囊泡(EVs)与肿瘤微环境

细胞外囊泡(EVs)是近年来在CNS肿瘤研究中备受关注的另一类生物标志物。EVs是由肿瘤细胞分泌的纳米级囊泡,能够携带肿瘤相关的生物分子,如蛋白质、脂质、mRNA和miRNA等。这些囊泡不仅能够反映肿瘤的分子特征,还能作为肿瘤微环境(TME)的“窗口”,为研究者提供关于肿瘤侵袭性和治疗反应的重要信息。

EVs的检测通常依赖于超速离心、纳米颗粒追踪分析(NTA)和透射电子显微镜(TEM)等技术。此外,流式细胞术和Western blotting也被用于EVs的表征。这些技术能够帮助研究者识别和分析EVs中的生物分子,从而揭示肿瘤的生物学行为。

尽管EVs在CNS肿瘤研究中展现出巨大潜力,但其检测和分析仍面临一定的技术挑战。例如,EVs的分离和纯化过程较为复杂,现有的方法可能存在一定的重复性和特异性问题。此外,EVs的检测结果可能受到多种因素的影响,如样本的处理条件、EVs的来源和数量等。因此,开发更加标准化和高效的EVs检测技术是未来研究的重要方向。

### 循环蛋白与免疫反应

循环蛋白(CP)是另一种重要的生物标志物,它们能够反映肿瘤相关的免疫反应和病理特征。例如,YKL-40是一种与肿瘤负担和不良预后相关的循环蛋白,其水平的升高可能预示肿瘤的进展和复发。此外,VEGF(血管内皮生长因子)的表达水平与肿瘤的血管生成密切相关,因此在胶质母细胞瘤的治疗中具有重要意义。

除了YKL-40和VEGF,其他循环蛋白如PAI-1(纤溶酶原激活物抑制剂-1)和HGF(肝细胞生长因子)也被研究发现与CNS肿瘤相关。这些蛋白的检测可以帮助医生评估患者的治疗反应,并指导治疗方案的调整。然而,循环蛋白的检测仍面临一些挑战,如其特异性不足、与其他非肿瘤条件的重叠等。因此,需要进一步研究这些蛋白的生物学功能,并探索其在CNS肿瘤诊断和治疗中的应用。

### 临床应用与未来展望

生物标志物的临床应用正在逐步改变CNS肿瘤的治疗策略。例如,MGMT启动子甲基化已被用于指导胶质母细胞瘤患者的化疗选择,而IDH1/2突变则被用于区分不同类型的胶质瘤,并预测其对治疗的反应。此外,1p/19q共缺失在寡切片胶质瘤的诊断和预后评估中具有重要价值,而H3K27M突变则成为弥漫性中线胶质瘤的重要标志。

然而,尽管这些生物标志物在临床研究中展现出良好的前景,其实际应用仍受到一些因素的限制。首先,不同实验室之间的检测方法和结果解读存在差异,这可能影响其在临床实践中的一致性。其次,分子诊断的费用和可及性在不同国家和地区存在显著差异,特别是在低收入国家,高昂的检测成本可能限制了其广泛使用。此外,生物标志物的标准化和验证仍然是一个重要的挑战,需要进一步的研究和国际合作。

为了推动生物标志物在CNS肿瘤中的应用,研究者正在探索更高效的检测技术和标准化的验证流程。例如,通过开发更敏感的测序平台和优化EVs的分离技术,可以提高生物标志物的检测准确性和可重复性。此外,人工智能(AI)和机器学习技术也被应用于生物标志物的发现和分析,为精准医学的发展提供了新的工具。

未来的研究方向包括:开发新的生物标志物、优化检测技术和分析方法、提高检测的灵敏度和特异性、推动生物标志物的标准化和普及。同时,还需要关注生物标志物在不同人群中的适用性,特别是低收入和资源匮乏地区的患者。通过国际合作和政策支持,可以缩小不同地区在生物标志物检测和应用上的差距,提高全球范围内的医疗公平性。

### 精准医学与生物标志物的整合

精准医学的核心在于根据患者的个体差异制定个性化的治疗方案。生物标志物的发现和应用为这一目标提供了重要的支持。例如,通过检测患者的分子特征,医生可以更准确地判断其对特定治疗的敏感性,并选择最适合的药物和治疗策略。这不仅能够提高治疗效果,还能减少不必要的副作用,提高患者的生活质量。

然而,生物标志物的整合仍然面临诸多挑战。首先,不同类型的生物标志物可能需要不同的检测方法,这增加了临床应用的复杂性。其次,生物标志物的检测结果可能受到多种因素的影响,如样本的处理条件、检测平台的灵敏度和特异性等。因此,需要进一步优化检测流程,并建立统一的检测标准。

此外,生物标志物的检测和分析还需要大量的临床数据支持。通过多中心的临床研究,可以更好地验证生物标志物的临床价值,并推动其在实际医疗中的应用。同时,生物标志物的检测还应与患者的治疗方案相结合,以实现最佳的治疗效果。

总之,生物标志物在CNS肿瘤的诊断、预后评估和治疗指导中发挥着越来越重要的作用。随着技术的不断进步,液态活检和分子标志物的检测方法将变得更加高效和标准化,从而推动精准医学在CNS肿瘤中的应用。然而,为了实现这一目标,还需要解决一系列技术和伦理问题,包括样本处理的标准化、检测方法的优化、数据的整合以及全球范围内的医疗公平性等。
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