DCN、NPM3与SULF1作为肺腺癌血管生成拟态关键标志物的作用机制与临床意义研究

《Journal of Cancer Research and Clinical Oncology》:DCN, NPM3 and SULF1 are hub genes related to vasculogenic mimicry in lung adenocarcinoma

【字体: 时间:2025年11月09日 来源:Journal of Cancer Research and Clinical Oncology 2.8

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  本研究针对肺腺癌(LUAD)中血管生成拟态(VM)形成机制不明确、缺乏有效治疗靶点的问题,通过整合生物信息学与实验验证,系统筛选出VM相关关键基因DCN、NPM3和SULF1。研究发现SULF1通过VEGF/TGF-β/Vimentin信号轴促进VM形成,并揭示其与肿瘤免疫微环境的相互作用。该研究为LUAD的VM靶向治疗提供了新的理论依据和潜在靶点。

  
在全球范围内,肺癌始终是癌症相关死亡的主要原因,其中肺腺癌(LUAD)作为非小细胞肺癌(NSCLC)中最常见的亚型,以其高侵袭性、易复发和活跃的血管生成特性而备受关注。尽管靶向治疗和免疫治疗的出现显著改善了患者预后,但耐药性和疾病复发仍是临床面临的严峻挑战。在这一背景下,血管生成拟态(VM)——一种不依赖内皮细胞、由肿瘤细胞自身形成血管样通道的现象——逐渐成为肿瘤研究的新焦点。VM与肿瘤的恶性进展密切相关,不仅为肿瘤提供替代血供,还可能导致抗血管生成治疗(如VEGF抑制剂)的疗效受限。因此,深入揭示LUAD中VM形成的分子机制,对于开发新的治疗策略具有重要意义。
为系统探索VM在LUAD中的作用,研究人员在《Journal of Cancer Research and Clinical Oncology》上发表了一项整合生物信息学与实验验证的研究。该研究首先利用TCGA和GEO数据库的转录组数据,通过差异表达分析(DEA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选VM相关基因,并结合机器学习算法进一步提炼关键基因。随后,通过功能富集分析、免疫浸润分析以及体外体内实验,验证了关键基因的功能及其临床意义。
研究主要采用的关键技术方法包括:基于TCGA队列(541例肿瘤样本与59例正常组织)和GEO数据集GSE140797的转录组数据分析;通过DEA和WGCNA识别VM相关模块与基因;利用LASSO回归与随机森林(RF)机器学习算法筛选核心基因;功能富集分析(GO与KEGG)揭示生物学通路;免疫浸润分析评估肿瘤微环境特征;并通过体外细胞实验(如Transwell迁移/侵袭实验、三维培养模型)和裸鼠移植瘤模型验证SULF1基因的功能。
Screening of DEGs related to VM in LUAD
通过差异表达分析,研究共识别出10,810个差异表达基因,其中6,587个上调,4,223个下调。WGCNA分析进一步锁定与VM最相关的黄色与棕色模块,从中筛选出101个VM相关候选基因。
Functional enrichment and PPI network of candidate genes
候选基因主要富集于细胞外基质(ECM)组织、核糖体通路和蛋白质代谢等生物学过程。蛋白互作网络分析提示这些基因在VM形成中具有协同作用。
Identification of key genes through machine learning and expression validation
LASSO与RF机器学习方法共同筛选出DCN、NPM3和SULF1三个核心基因。表达验证显示,DCN在LUAD组织中下调,而NPM3与SULF1显著上调,且在蛋白水平得到免疫组化结果支持。
Molecular regulatory network and GSEA of key genes
转录调控网络分析表明,DCN、NPM3与多种转录因子存在相互作用。基因集富集分析(GSEA)显示这些基因广泛参与EGFR信号、缺氧反应及翻译起始等通路。
Immune infiltration analysis in LUAD
免疫浸润分析发现,DCN表达与多种免疫细胞(如活化B细胞、CD4+/CD8+ T细胞)呈正相关,而NPM3与SULF1则与免疫细胞浸润负相关,提示其可能参与免疫抑制微环境的塑造。
Overexpression of SULF1 promoted VM in A549 cells
体外功能实验表明,SULF1过表达显著增强A549细胞的VM形成能力,三维培养模型中管状结构数量增加,PAS染色显示基底膜样成分沉积增多。
Overexpression of SULF1 enhanced the migration and invasion of A549 cells
Transwell实验证实SULF1过表达促进细胞迁移与侵袭。Western blot结果显示VEGF、TGF-β与Vimentin蛋白表达上调,表明SULF1可能通过该信号轴驱动VM进程。
Overexpression of SULF1 accelerated tumor growth in nude mice
体内实验进一步验证SULF1的促瘤作用,过表达SULF1的移植瘤体积显著大于对照组,从动物水平确认了其促进LUAD进展的功能。
研究结论指出,DCN、NPM3和SULF1是LUAD中VM形成的关键调控因子。其中SULF1通过激活VEGF/TGF-β/Vimentin轴显著促进VM、增强肿瘤细胞侵袭能力,并影响肿瘤免疫微环境。该研究不仅深化了对VM分子机制的理解,也为克服LUAD治疗抵抗提供了新的靶点与策略。值得注意的是,SULF1在多种癌症中表现出双重调控作用,本研究发现其在LUAD中作为致癌基因的特征,为后续转化研究奠定基础。尽管研究存在样本来源与空间验证方面的局限,其系统性分析框架与多维度验证手段仍为VM研究提供了重要范式。
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