《British Journal of Anaesthesia》：Comparative transcriptomic meta-analysis reveals elevated
TCL1A expression in human circulating immune cells across chronic pain conditions
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通过转录组学元分析比较慢性疼痛患者与对照者的免疫细胞表达谱，发现性别差异显著，女性患者中TCL1A基因表达升高并与神经病理性疼痛严重程度相关。
理查德·K·佩雷斯（Richard K. Perez）|薇薇安·L·陶菲克（Vivianne L. Tawfik）
美国加利福尼亚州斯坦福大学医学院麻醉学、围手术期与疼痛医学系
摘要
背景
慢性疼痛影响着全球数百万人。其管理因多种风险因素、症状的多样性以及缺乏生物标志物而变得复杂。研究通常从人类免疫系统的角度来探讨疼痛，因为免疫系统的失调可能加剧疼痛。然而，尽管已知性别在免疫反应上存在差异（女性患自身免疫疾病和慢性疼痛的风险更高），但大多数研究仍将男女混为一谈。合并数据并调整性别因素可能会掩盖与慢性疼痛相关的性别特异性免疫特征，从而限制我们对疼痛起源的理解。
方法
通过转录组荟萃分析，我们重新处理了多项关于多种慢性疼痛状态下人体循环免疫细胞的批量RNA测序研究，以检测常见的以及之前被忽视的性别特异性转录组特征。
结果
我们的荟萃分析涵盖了142名慢性疼痛患者和154名对照受试者的循环免疫细胞批量RNA测序数据，这些受试者患有六种不同的慢性疼痛疾病。性别分层分析显示，在女性中有19个基因的表达发生了变化，其中包括与自身免疫相关的TCL1A基因。值得注意的是，TCL1A基因的表达与神经病理性症状的严重程度相关（P<0.05）。在独立队列中的蛋白质水平验证证实了这些发现。
结论
通过对公开可获取的数据进行转录组荟萃分析，我们识别出了在不同疼痛疾病中普遍存在的基因，并发现了性别特异性特征，包括在部分女性中TCL1A基因表达的增加，这可能成为神经病理性疼痛的潜在生物标志物。
部分内容摘录
研究识别
纳入标准是来自患有慢性疼痛的受试者的公开可获取的批量RNA测序文件（全血或外周血单核细胞[PBMCs]）。研究必须包含对照组。为了识别这些数据集，我们进行了以下PubMed搜索：((“RNA测序”) AND (人类) AND ((疼痛) OR (神经病理性) OR (慢性疼痛) OR (急性疼痛))) AND (((血液) OR (白细胞) OR (PBMC) OR (外周血单核
差异基因表达分析
多项微阵列和批量RNA测序研究适用于比较不同疼痛状态下的差异基因表达（图1b）。然而，只有五项研究的原始批量RNA测序数据可供后续分析使用。已发表的差异基因表达数据的交集显示了各种疼痛状态下的共有基因（图1b）。为了复制和扩展这一发现，我们使用统一的流程处理了来自五项疼痛研究的样本，从FASTQ数据开始直至差异基因表达分析。
讨论
我们的转录组荟萃分析发现了一系列慢性疼痛状态下的共有基因表达模式。荟萃分析有助于直接评估各研究之间的共性，并进行原始研究可能因样本量不足而无法进行的分析。通常，单个研究的结论依赖于效应量较大的基因，因为这些基因不太可能仅由技术因素引起，而效应量较小的基因虽然可能不太显著，但在临床上仍具有重要意义。
作者贡献
提出原始想法、设计研究、进行分析并撰写和编辑手稿：RKP
协助完善研究概念并对手稿进行关键修订：VLT
数据可用性声明
所有原始FASTQ文件可在原始论文中描述的存储库中找到。本研究的原始计数矩阵数据和脚本可在Dryad平台上获取。
关于写作过程中生成式AI和AI辅助技术的声明
在准备本工作时，作者仅使用OpenAI的GPT o4-mini工具来改善句子流畅性和语法。使用该工具后，作者根据需要对内容进行了审核和编辑，并对出版物的内容负全责。
资助
斯坦福大学医学院麻醉学系、围手术期与疼痛医学部门；美国国立卫生研究院（资助编号R35GM137906）。
致谢
我们感谢偏头痛和腰痛研究的作者，他们在我们的请求下提供了有用的额外元数据。
