PIP4K2A：一种与慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者肺功能下降相关的新型CD8+ T细胞相关生物标志物

《Biochemical Genetics》：PIP4K2A: A Novel CD8+?T Cell-Related Biomarker Associated with Lung Function Decline in COPD

CD8+ T细胞通过炎症介导COPD发展，本研究整合生物信息学与实验验证，利用GEO数据库的肺组织测序数据，通过R分析、LASSO回归及GO/KEGG富集分析筛选出7个CD8+ T细胞相关基因（CST7、HSPA8、PXN、YPEL5、PIP4K2A、CDKN1B、PIK3IP1），构建高效诊断模型，其中PIP4K2A与肺功能下降显著相关，qRT-PCR验证确认其表达模式。为解析CD8+ T细胞介导的COPD机制提供新证据。

　　

摘要

CD8+ T细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）的炎症发病机制中起着关键作用。为了阐明CD8+ T细胞参与COPD发展的分子机制，本研究采用了一种综合方法，结合生物信息学分析和实验验证来识别与CD8+ T细胞相关的标记基因，构建了一个诊断模型，并评估这些基因与COPD患者肺功能的相关性。COPD患者和对照组的肺组织测序数据来自基因表达组学数据库（Gene Expression Omnibus, GEO）。使用R语言对批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集进行了差异表达分析。随后应用LASSO回归分析来识别核心基因，并通过基因本体论（Gene Ontology, GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）的富集分析进行功能注释。线性回归分析评估了关键基因与肺功能参数之间的相关性，并使用COPD患者和健康对照组的临床样本对三个与肺功能相关的基因进行了qRT-PCR验证。我们的分析确定了七个与CD8+ T细胞相关的基因（CST7、HSPA8、PXN、YPEL5、PIP4K2A、CDKN1B、PIK3IP1），这些基因共同构成了一个高效的诊断模型。其中，HSPA8、PIP4K2A和YPEL5与COPD患者的肺功能受损有显著相关性。qRT-PCR验证证实了临床样本中PIP4K2A的表达模式与微阵列数据一致。这些发现建立了与CD8+ T细胞相关的COPD生物标志物，其中PIP4K2A的表达与肺功能下降具有特别相关性，从而为COPD发病机制中CD8+ T细胞的介导机制提供了新的分子见解。

图形摘要