ISOMED:地中海海洋食物网稳定同位素数据库的构建与应用
《Scientific Data》:ISOMED - A Stable ISOtope database of MEDiterranean marine food web components
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时间:2025年11月12日
来源:Scientific Data 6.9
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为应对地中海生态系统评估中稳定同位素数据分散、缺乏整合的挑战,研究人员开发了ISOMED数据库,系统收录了1997–2020年间地中海海域有机碳(δ13C)和氮稳定同位素(δ15N)数据及元素组成(C/N)的4959条记录。该数据库涵盖从基础有机质来源(如浮游植物、悬浮有机物)到高营养级消费者(如鱼类、海洋哺乳动物)的完整食物网组分,并通过地理编码和标准化分类(WoRMS)支持空间分析与模型构建。ISOMED为研究地中海食物网结构、能量流动及人类压力(如过度捕捞、气候变化)的影响提供了关键工具,直接助力欧盟海洋战略框架指令(MSFD)中描述符4(食物网评估)的实施。
地中海作为全球生物多样性热点区域,拥有超过1.7万种海洋生物,却同时面临着气候变化、过度捕捞和沿海污染等多重压力。如何科学评估这些人为活动对海洋生态系统的累积影响,成为实施生态系统管理(如欧盟海洋战略框架指令MSFD)的核心挑战。其中,食物网作为能量流动和物种相互作用的载体,其结构与功能的解析至关重要。传统食性分析方法(如胃含物分析)难以适用于所有类群,而碳(δ13C)和氮稳定同位素(δ15N)技术可通过同位素分馏效应追溯营养来源与层级,成为研究食物网的有力工具。然而,地中海地区的稳定同位素数据长期存在分布零散、标准不一的问题,限制了区域尺度的生态评估。
为此,由Daniela Berto、Emanuela Fanelli、Salvatrice Vizzini等来自意大利多家研究机构的研究团队在《Scientific Data》发表了题为“ISOMED-A Stable Isotope DATA DESCRIPTOR database of MEDiterranean marine food web components”的论文,构建了首个覆盖地中海全海域的稳定同位素数据库ISOMED。该数据库整合了1997–2020年间发表的4959条地理编码记录,涵盖从基础有机质(如悬浮有机物、沉积有机物)到顶级捕食者(如僧海豹Monachus monachus)的完整食物网组分,每条记录均包含δ13C、δ15N值、碳氮元素比(C/N)及采样位置、时间、生物样本信息(如体长、组织类型)等38项标准化参数。
研究团队通过系统性文献检索(Web of Science关键词组合)筛选出331篇相关论文,并依据数据原创性、样本一致性和地理可溯源性标准提取数据。所有数据经标准化处理:物种分类统一参照海洋物种名录(WoRMS),地理坐标转换为十进制并关联至国际海区(IHO)、MSFD子区域和FAO渔业分区。样本预处理信息(如脱脂、酸处理)与同位素值误差类型(标准偏差、标准误)均被记录,异常值通过交叉核对原文剔除。数据库最终以Excel格式存储,符合FAIR数据原则,并通过SEANOE平台开放获取。
- ••空间分布:ISOMED的4959条记录覆盖地中海四大MSFD子区域,其中西地中海子区域(MWE)数据量最丰富(3674条),其次为亚得里亚海(619条)、爱琴海-黎凡特海(431条)和伊奥尼亚海-中地中海(235条)。
- ••食物网层级构成:基础有机质来源与低阶消费者(如浮游生物、大型藻类)占比29%(1429条),高阶消费者(如鱼类、无脊椎动物)占比71%(3530条)。
- ••
- ••基础来源(图2):悬浮有机物(Suspended Organic Matter)、沉积有机物(Sedimentary Organic Matter)和浮游植物(Phytoplankton)为主要功能类别,西地中海区域数据覆盖度最高。
- ••高阶消费者(图3、4):脊椎动物(主要为硬骨鱼类和海洋哺乳动物)占52%,无脊椎动物中以节肢动物(如甲壳类)和软体动物(如双壳类)为主。稀有类群(如腕足动物、纽虫)记录不足1%。
数据库通过多重质控确保可靠性:重复记录与拼写错误被剔除;δ13C和δ15N异常值经原文核对后修正或删除;样本预处理信息(如脱脂、酸处理)标准化标注;缺失元数据以“Not applicable”标识。所有记录经SEANOE平台同行评审后发布。
ISOMED数据库首次实现了地中海海域稳定同位素数据的系统整合,其空间明确性与标准化结构为多维度研究提供支撑:
- 1.1.生态模型构建:可精准估算物种营养级(Trophic Level),支持质量平衡模型(如Ecopath with Ecosim)中的食性矩阵参数化;
- 2.2.环境评估应用:直接服务于MSFD描述符4(食物网指标)和联合国可持续发展目标14(水下生物)的监测需求;
- 3.3.压力响应解析:通过关联人类活动数据(如养殖区、污染梯度),可揭示气候变化、渔业捕捞等压力对食物网结构的影响机制。
未来,ISOMED将通过持续纳入新数据扩展时空与类群覆盖,推动地中海生态系统管理的科学决策。
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