靶向多药耐药霍乱弧菌DGCs的黄酮类化合物抗生物膜机制研究:白杨素与菲瑟酮的干预效应
《Scientific Reports》:Flavonoids interfere with biofilm formation by targeting diguanylate cyclases in multidrug resistant Vibrio cholerae
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时间:2025年11月12日
来源:Scientific Reports 3.9
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本研究针对全球范围内日益严重的抗生素耐药性问题,以霍乱弧菌(Vibrio cholerae)生物膜为靶点,探索天然黄酮类化合物白杨素(baicalein)与菲瑟酮(fisetin)的抗生物膜潜力。研究人员通过体外实验、基因表达分析及分子模拟技术,首次揭示两种黄酮可通过抑制双鸟苷酸环化酶(DGCs)活性,干扰第二信使c-di-GMP信号通路,显著破坏霍乱弧菌生物膜形成及其耐药性。该研究为开发新型抗霍乱策略提供了理论依据,对应对多重耐药菌感染具有重要意义。
霍乱,这一曾被视作“被遗忘的瘟疫”,至今仍在全球南部地区(如南亚、东南亚、非洲及拉丁美洲)持续肆虐。世界卫生组织数据显示,2023年全球霍乱病例数较2022年增长13%,死亡率飙升126%,凸显其严峻的公共卫生威胁。霍乱弧菌作为病原体,不仅能在水生环境中长期存活,更擅长通过形成生物膜(biofilm)在人体肠道中顽固定植。这种“微生物堡垒”使细菌对抗生素的耐受性提升数十倍,导致传统疗法频频失效。尤其令人担忧的是,多重耐药(MDR)和广泛耐药(XDR)霍乱弧菌株的涌现,使得本已有限的治疗选择雪上加霜。在疫苗保护期有限、抗生素疗效下降的背景下,靶向生物膜已成为对抗霍乱的新希望。
近日,发表于《Scientific Reports》的一项研究首次揭示:两种天然黄酮类化合物——白杨素(baicalein)与菲瑟酮(fisetin),可通过精准抑制霍乱弧菌的双鸟苷酸环化酶(DGCs),阻断其环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号通路,从而高效瓦解生物膜。该研究不仅明确了化合物的活性浓度,还通过分子模拟阐明了菲瑟酮更具优势的结构机制,为抗霍乱药物研发提供了新靶点与先导化合物。
为系统评估黄酮类化合物的抗生物膜效能,研究团队选取两株高生物膜形成能力的MDR霍乱弧菌临床分离株(TM14与TM36),通过微量稀释法测定最小生物膜抑制浓度(MBIC)与最小生物膜清除浓度(MBEC);借助扫描电镜(SEM)和原子力显微镜(AFM)直观观察生物膜结构变化;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析生物膜相关基因表达;并利用分子对接与分子动力学(MD)模拟预测化合物与DGC活性中心的结合模式。此外,通过细胞毒性实验与溶血活性检测验证化合物生物相容性,依托SwissADME和ProTox-3平台进行ADMET(吸收、分布、代谢、排泄、毒性)特性预测。
黄酮类化合物展现低毒性且高效抗生物膜活性
研究发现,白杨素与菲瑟酮在50–100 μg/mL浓度范围内对人淋巴细胞存活率均高于75%,溶血活性低于20%,表明其具有良好生物安全性。菲瑟酮的抗生物膜效能显著优于白杨素:其对霍乱弧菌的MBIC为30 μg/mL,MBEC为50 μg/mL,而白杨素分别为40 μg/mL和70 μg/mL。扫描电镜图像清晰显示,经黄酮处理后,细菌生物膜结构由致密网状退化为稀疏碎片,且菲瑟酮处理组中几乎无完整菌体聚集。
黄酮破坏生物膜基质结构与代谢功能
通过酚硫酸法与Lowry法测定,菲瑟酮使胞外聚合物(EPS)中多糖含量降低53.5%,蛋白质含量降低46.6%。原子力显微镜进一步显示,菲瑟酮将生物膜厚度从1.31 μm削减至0.52 μm,表明白黄酮能有效瓦解生物膜物理屏障。MTT实验表明,黄酮处理后的生物膜代谢活性下降约50%,提示其可能通过抑制能量代谢关键酶(如磷酸果糖激酶)削弱细菌生存能力。
黄酮削弱细菌黏附与信号分子合成
菲瑟酮使霍乱弧菌菌体自聚能力降低37.9%,表面疏水性下降43.3%,显著抑制其附着于生物或非生物表面。此外,黄酮处理导致细菌吲哚产量下降51.9%,该分子作为群体感应信号分子,原本可激活生物膜调控蛋白VpsR与VpsT,其减少进一步佐证黄酮对群体感应系统的干扰。
靶向DGC-c-di-GMP通路是抗生物膜核心机制
基因表达分析发现,菲瑟酮使6种关键DGCs(cdgA、cdgH、cdgK、cdgL、cdgM、vpvC)的表达量下调42.7%–75.8%,其中对cdgH与cdgM的抑制最为显著。下游调控因子aphA(c-di-GMP活性标志物)表达量降低63.8%,vpsT(依赖c-di-GMP激活)表达量下降66.3%,证实黄酮通过降低细胞内c-di-GMP水平,阻断生物膜形成信号通路。
分子模拟揭示菲瑟酮优势结合模式
分子对接显示,菲瑟酮与DGC活性中心(GGDEF结构域)结合能为-6.9 kcal/mol,优于白杨素(-6.3 kcal/mol)。菲瑟酮的C3、C4、C7、C3′位羟基与Glu238形成三重氢键,该残基是GTP底物催化关键位点,其结合可直接阻断c-di-GMP合成。分子动力学模拟中,菲瑟酮-蛋白复合物的RMSD(均方根偏差)始终低于0.3 nm,RMSF(均方根涨落)与Rg(回转半径)值均表明显著结构稳定性,从理论上解释了菲瑟酮的高效性。
本研究首次系统证实黄酮类化合物可通过靶向DGCs调控c-di-GMP通路,瓦解霍乱弧菌生物膜。菲瑟酮因其羟基位置优化(C3、C4、C7、C3′),展现更强抑制效能,且具备低毒性、高胃肠吸收度与无神经毒性等优势。该发现不仅为抗霍乱药物设计提供了新靶点(DGCs),还提示天然黄酮可作为“抗生物膜-表面消毒”双功能制剂,用于水源、食品容器等生物膜清除。未来研究需进一步开展动物模型验证,推动该类化合物向临床转化,助力WHO“2030年将霍乱死亡率降低90%”的防控目标。
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