在0.4 K温度下,研究丙炔酸与水形成的复合物中结合位点的偏好性
《Physical Chemistry Chemical Physics》:Probing binding-site preferences in a propiolic acid complex with water at 0.4 K
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年11月13日
来源:Physical Chemistry Chemical Physics 2.9
编辑推荐:
氢键作用与极性分子在超低温环境下的构象选择性研究。通过氦纳米滴(HND)技术结合质谱和红外光谱,发现丙酸(PA)与D?O形成三种稳定异构体复合物,其中以非经典C≡CH…OD?O和经典C=O…DOD氢键为主。计算表明PA与D?O的极性相互作用导致动力学陷阱,主导形成局部能量最小结构,而非热力学最稳定构型。该研究揭示了超低温下分子间相互作用的多重调控机制。
在极端低温条件下,研究分子间的相互作用对于理解化学和物理过程具有重要意义。特别是对于生物化学和大气化学领域,氢键(HB)作为关键的非共价相互作用,不仅影响分子结构的稳定性,还对物质的聚集行为产生深远影响。近年来,随着低温实验技术的发展,例如氦气纳米液滴(HND)技术,科学家能够探索那些在常规条件下难以研究的分子间相互作用。该技术利用超冷温度(约0.4 K)和超流体特性,使得分子能够在形成复合物时被有效地“捕获”,从而揭示其动态行为和结构特征。
本研究聚焦于丙二酸(propiolic acid,PA)与重水(D?O)之间的氢键作用。PA是一种具有多重氢键供体和受体的分子,其结构包含一个羧基(–COOH)和一个炔基(–C≡CH)官能团。这种结构特征使其在形成与D?O的复合物时,能够产生多种不同的氢键模式。实验中采用HND技术,结合质量选择红外光谱(IR)分析,研究了PA与D?O的1:1二聚体的结构偏好和稳定情况。通过控制氦气纳米液滴的掺杂过程,研究人员能够精确地识别出不同的氢键结构,并进一步探讨这些结构的相对稳定性。
在实验中,研究人员发现,PA在HND中仅能稳定为一个特定的构型——即顺式(cis)构型(c-PA),而反式(trans)构型(t-PA)在能量上高出约12 kJ mol?1。这一结果与之前的固体基质实验(如氮气、氖气和氩气)相吻合。通过比较实验观测到的红外光谱特征与理论计算的谐波频率,研究人员能够对PA的构型进行明确的结构归类。此外,实验还揭示了PA与D?O形成的三个不同的二聚体构型,其中两个具有较高的能量(分别高于全球最小能量结构约20 kJ mol?1),它们在红外光谱中表现出显著的特征。
实验所记录的红外光谱显示,PA的C=O伸缩振动主要出现在1762.5 cm?1,而C≡C伸缩振动则出现在2142.6 cm?1。在PA与D?O形成的二聚体中,红外光谱表现出更多的吸收峰,如1758.5 cm?1(a?)、1743.3 cm?1(a?)、1729.5 cm?1(a?)、2134.6 cm?1(a?)和2141.7 cm?1(a?)。这些吸收峰分别对应不同的氢键模式,其中a?和a?可能涉及非经典的氢键形成,而a?和a?则可能涉及经典的氢键作用。最弱的吸收峰则与全球最小能量结构有关,表明该结构具有一定的稳定性。
研究人员进一步通过计算获得这些二聚体的相对能量和相互作用能。计算结果表明,PA与D?O形成的二聚体中,全球最小能量结构(c-PAw-1)的稳定性显著高于其他两个局部最小能量结构(c-PAw-2和c-PAw-3)。这表明,在HND的超低温环境中,分子的聚集路径受到长程电荷-电荷相互作用(即偶极-偶极相互作用)的引导,而非经典的氢键作用则在一定程度上稳定了局部结构。此外,这些结构之间的能量转换障碍也符合HND中的动力学捕获现象,说明在极低温下,热能不足以克服这些结构之间的转换势垒,从而使得局部结构在实验中得以保留。
研究还指出,PA和D?O的偶极矩分别为1.59 D和1.85 D,这表明它们之间存在较强的偶极-偶极相互作用,进而影响其氢键形成过程。在HND中,分子的聚集过程可以分为两个阶段:首先,通过偶极-偶极相互作用实现长程接近;随后,在接触过程中通过最可能的氢键作用完成短程稳定。这一机制在其他研究中已有报道,例如在丙炔和乙炔与水分子形成的复合物中,也观察到了类似的动态过程。
通过比较实验数据和理论计算结果,研究人员能够明确归类出三种不同的氢键模式。其中,非经典的氢键形成(如C≡C–H?OD?)在能量上较高,但可能在某些情况下更稳定;而经典的氢键作用(如C=O?DOD)则在能量上较低,但可能更普遍。这些结构之间的相互作用能和能量转换障碍进一步支持了HND中动力学捕获现象的存在,即在超低温条件下,局部结构比全球最小能量结构更容易被观测到。
此外,研究还探讨了氢键模式对分子聚集行为的影响。在HND中,分子的排列和相互作用受到偶极矩的影响,从而形成特定的氢键结构。这种结构偏好在多种系统中均可见,如丙炔醇与水形成的复合物,以及在气相和固相中观察到的其他氢键体系。这些发现表明,在超低温和超流体条件下,分子间的相互作用不仅受到热力学因素的影响,还受到动力学因素的控制。
研究还强调,通过HND技术能够揭示分子在极端条件下的行为,这对于理解大气化学、生物化学以及材料科学中的分子相互作用具有重要意义。例如,在大气气溶胶的形成过程中,非经典的氢键作用可能在分子聚集过程中发挥关键作用,从而影响气溶胶的结构和性质。同样,在星际化学环境中,分子的相互作用也可能遵循类似的规律,为研究星际化学提供了新的视角。
综上所述,本研究通过HND技术结合红外光谱分析,揭示了丙二酸与重水形成的二聚体的结构偏好和稳定性。这些结果不仅加深了对氢键作用的理解,还为研究分子在极端条件下的行为提供了新的实验依据。此外,研究还指出,分子的偶极矩在氢键形成过程中起着重要作用,这可能对分子的聚集路径和结构稳定性产生深远影响。这些发现对于理解生物化学、大气化学以及材料科学中的分子相互作用具有重要意义,并为未来的相关研究提供了理论支持和实验基础。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号