不同种植年份下丹参（Salvia miltiorrhiza）根际微生物多样性研究

《Letters in Applied Microbiology》：Microbial Diversity in Salvia miltiorrhiza Rhizosphere Across Cropping Years

丹参连作影响土壤微生物群落，三年连作土壤有益菌（芽孢杆菌、酸热菌）减少，病原真菌（镰刀菌）在两年连作时达峰值。LEfSe分析显示Candidatus Solibacter、Sphingomonas、RB41和Chitinophaga为细菌生物标志物，Talaromyces、Thermomyces、Trichothecium、Solicoccozyma和Pseudopithomyces为真菌标志物。总氮与Candidatus Solibacter和Solicoccozyma正相关，与Sphingomonas和RB41负相关；有机质与Sphingomonas负相关，Candidatus Solibacter与Sphingomonas负相关。

　　

摘要

连续耕作可能导致土壤养分失衡，并对土壤根际微生物产生不利影响。本研究通过比较四种种植方式（CK：不进行耕作；D1：每年种植一次；D2：连续两年种植；D3：连续三年种植），探讨了丹参连续耕作对根际土壤微生物群落的影响。采用高通量测序技术分析了根际土壤微生物群落的变化。结果表明，与CK组相比，丹参种植后的土壤中有益细菌（如芽孢杆菌和嗜酸菌）的丰度较低。在D2组土壤中，病原真菌镰刀菌的丰度最高。通过线性判别分析（LEfSe）在属水平上识别出多个细菌标志物，包括g_Candidatus_Solibacter、g_Sphingomonas、g_RB41和g_Chitinophaga；真菌标志物包括g_Talaromyces、g_Thermomyces、g_Trichothecium、g_Solicoccozyma和g_Pseudopithomyces。这些微生物标志物与环境因素的相关性分析显示：总氮含量与细菌g_Candidatus_Solibacter和真菌g_Solicoccozyma呈显著正相关，而与细菌g_Sphingomonas和g_RB41呈显著负相关；土壤有机质含量与g_Sphingomonas呈负相关；g_Candidatus_Solibacter也与g_Sphingomonas呈负相关。