印度南部野生与圈养濒危亚洲象（Elephas maximus indicus）肠道微生物组的多样性及差异

《Antonie van Leeuwenhoek》：Intestinal microbiome diversity and disparity between wild and captive endangered Asian elephants (Elephas maximus indicus) in southern India

本研究对比了圈养与野生亚洲象的肠道菌群，通过高通量16S rRNA测序发现，圈养象因环境压力导致Firmicutes等优势菌群比例降低，而Kiritimatiellaeota等门类丰度显著升高，揭示了饮食与环境对肠道菌群结构的影响。

　　

摘要

肠道微生物组影响着动物的身心健康。多种因素，包括饮食、宿主生理状况、年龄、性别、生活方式和环境因素，都会影响肠道微生物组的动态变化。我们研究了在长期圈养条件下（15.8 ± 3.9年）生活的濒危亚洲象（Elephas maximus）及其野生同类群体的肠道微生物组组成，因为两者都面临着不同的环境压力。通过高通量16S rRNA基因测序，我们获得了共计648,581条高质量序列，这些序列属于22个门和97个目的208个微生物科。其中，90%的微生物属于厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）。分析结果显示，圈养象与野生象的肠道微生物组存在显著差异。圈养象体内Kiritimatiellaeota、Tenericutes、Euryarchaeota和Verrucomicrobia等微生物门的丰度较高，这表明圈养环境改变了肠道微生物组的组成。这些发现揭示了圈养象与野生象在肠道微生物组多样性方面的明显差异，进一步强调了饮食和环境条件在塑造大象肠道微生物组中的作用。