评估eDNA作为鱼类和海洋哺乳动物生物监测工具的可行性：主动采样与被动采样的优势比较

《Aquatic Sciences》：Evaluating eDNA as a marine biomonitoring tool for fishes and marine mammals: the utility of active versus passive sampling

环境DNA主动采样检测率更高但成本高，被动采样经济但无最佳时间。研究首次发现主动采样未目击却检测到海洋哺乳动物DNA，证实eDNA技术可补充传统监测。

　　

摘要

环境DNA（eDNA）采样是一种有前景的海洋生物多样性监测方法，有可能成为传统观测方法的有力补充。本研究评估了eDNA作为鱼类和海洋哺乳动物检测工具的效能。我们分析了被动式和主动式eDNA采样方法的总体实用性，以及这两种技术对海洋哺乳动物和鱼类的利弊。主动采样是通过过滤膜对2升水进行真空过滤；而被动采样则是将过滤器浸入海面下1米处进行被动吸收，采样持续时间介于5到60分钟之间。总共从澳大利亚东南部的两个海湾收集了51个样本（23个主动采样样本和28个被动采样样本），这些海湾在采样时有时有海洋哺乳动物的目击记录，有时则没有。使用针对线粒体12S核糖体RNA基因的通用脊椎动物引物，我们在28个样本中检测到了鱼类DNA，而在10个样本中检测到了海洋哺乳动物DNA，尽管在30次采样过程中都有海洋哺乳动物的目击记录。值得注意的是，有一个主动采样样本在没有海洋哺乳动物被直接观察到的情况下仍检测到了其DNA，这表明eDNA采样能够发现传统监测方法可能遗漏的海洋哺乳动物物种。没有一种单一的被动采样时间能够最有效地检测鱼类或海洋哺乳动物。虽然被动采样方法更具成本效益，但主动采样在检测数量上更多，并且在野外操作速度更快。本研究扩展了eDNA采样在海洋生物监测中的应用范围，并指出了需要改进的地方。