通过对TCP基因家族进行全基因组鉴定并对BjTCP18基因进行基因编辑，能够增加油菜（Brassica juncea）的分枝数量

《Functional & Integrative Genomics》：Genome-wide identification of TCP gene family and gene editing of BjTCP18 genes increases branching in Brassica juncea

该研究系统解析了芥菜（Brassica juncea）基因组中72个TCP基因家族成员的分布、分类及调控机制，发现其通过激素响应、光信号传导等顺式作用元件参与发育与胁迫应答，并通过CRISPR/Cas9编辑验证BjTCP18对分生组织发育的负调控作用。

　　

摘要

TCP（Teosinte branched1/Cincinnata/Proliferating Cell Factor）基因家族编码植物特异性的转录因子，这些转录因子对调控植物的生长、发育以及环境应激反应的多个方面至关重要。为了阐明TCP基因在调控芥菜（Brassica juncea）发育中的作用，本研究对TCP家族成员进行了全基因组范围的鉴定和全面分析。在叶芥菜的基因组中共鉴定出72个TCP基因，这些基因分布在17条染色体上，分布不均。根据保守结构域的特征，BjTCP基因被分为两个亚家族。对启动子区域的顺式作用元件分析发现，其中包含许多与激素响应、光信号传导、抗逆性和发育相关的元件。表达模式分析表明，BjTCP基因具有不同的表达特征。通过CRISPR/Cas9介导的基因编辑和转化实验进行的功能验证表明，BjTCP18在芥菜的分枝发育中起负调控作用。本研究为进一步阐明TCP基因家族对调控过程的影响以及BjTCP18基因在芥菜分枝发育中的作用提供了理论基础和候选基因资源。