澳大利亚新南威尔士州七英里海滩国家公园中一个孤立南方大滑翔鼠（Petauroides volans）种群的保护基因组学研究

《Conservation Genetics》：Conservation genomics of an isolated southern greater glider (Petauroides volans) population at Seven Mile Beach National Park, New South Wales, Australia

南方大袋貂孤立种群遗传多样性评估显示近交系数上升、杂合度下降及有效种群大小仅25.4，揭示遗传衰退风险，提出保护基因组学应用策略。

　　

摘要

规模小且孤立的种群容易发生近亲繁殖和遗传多样性丧失，这会增加它们的灭绝风险。南方大滑翔鼠（Petauroides volans）是一种濒危的澳大利亚有袋类动物，其栖息地遭受了严重破坏，种群数量在整个分布范围内持续下降。遗传评估和监测对于制定针对特定种群的保护管理措施至关重要。在这项研究中，我们利用保护基因组学方法研究了位于澳大利亚新南威尔士州七英里海滩国家公园（Seven Mile Beach National Park）的一个孤立沿海种群。我们分析了全基因组的SNP标记，以评估种群的基因组多样性和结构，并识别可能存在的遗传衰退迹象。研究发现，2020年至2024年间，该种群的杂合度降低，近亲繁殖现象加剧。通过距离隔离模式可以推断出种群遗传结构：在较短距离（<300米）内存在正的空间自相关性，表明局部遗传结构；而在较长距离（>2000米）内则呈现负的空间自相关性。此外，还观察到近亲之间的遗传相关性较高以及空间距离较近的现象，这些因素可能增加了近亲繁殖的风险。尽管未检测到近亲繁殖导致的不良后果，但估算的有效种群规模仅为25.4个个体，这对该种群的生存能力构成了严重威胁，亟需采取保护行动。本研究为隔离对南方大滑翔鼠种群基因组多样性和结构的影响提供了宝贵的见解。我们首次正式证明了七英里海滩国家公园内该种群的遗传衰退现象，并探讨了如何利用我们的基因组数据来指导保护管理工作。

规模小且孤立的种群容易发生近亲繁殖和遗传多样性丧失，这会增加它们的灭绝风险。南方大滑翔鼠（Petauroides volans）是一种濒危的澳大利亚有袋类动物，其栖息地遭受了严重破坏，种群数量在整个分布范围内持续下降。遗传评估和监测对于制定针对特定种群的保护管理措施至关重要。在这项研究中，我们利用保护基因组学方法研究了位于澳大利亚新南威尔士州七英里海滩国家公园的一个孤立沿海种群。我们分析了全基因组的SNP标记，以评估种群的基因组多样性和结构，并识别可能存在的遗传衰退迹象。研究发现，2020年至2024年间，该种群的杂合度降低，近亲繁殖现象加剧。通过距离隔离模式可以推断出种群遗传结构：在较短距离（<300米）内存在正的空间自相关性，表明局部遗传结构；而在较长距离（>2000米）内则呈现负的空间自相关性。此外，还观察到近亲之间的遗传相关性较高以及空间距离较近的现象，这些因素可能增加了近亲繁殖的风险。尽管未检测到近亲繁殖导致的不良后果，但估算的有效种群规模仅为25.4个个体，这对该种群的生存能力构成了严重威胁，亟需采取保护行动。本研究为隔离对南方大滑翔鼠种群基因组多样性和结构的影响提供了宝贵的见解。我们首次正式证明了七英里海滩国家公园内该种群的遗传衰退现象，并探讨了如何利用我们的基因组数据来指导保护管理工作。