2018年至2023年间日本儿童胃肠炎患者中腺病毒的分子流行病学及HAdV-D56的流行情况

《Journal of Medical Virology》：Molecular Epidemiology of Adenoviruses and Emergence of HAdV-D56 in Pediatric Patients With Gastroenteritis in Japan From 2018 to 2023

腺病毒（HAdV）是儿童急性胃肠炎的主要病原体，日本六 префектура（县）2018-2023年研究表明，后疫情时代（2022-2023）感染率从疫情前及期间的10.8%升至27.7%，并首次发现HAdV-D56在胃肠炎患者中致病。主要检测到F41、C1、C2、C5、C6、B3、A31、D56等8个基因型，其中F41占主导。研究提示HAdV流行特征随疫情变化，需持续全球监测。

　　

摘要

人腺病毒（HAdV）是全球范围内导致胃肠炎的主要原因之一，尤其是在儿童中。本研究旨在通过使用PCR方法以及对六角体基因中的高变区和非高变区进行测序，来调查2018年至2023年间日本六个不同地区患有急性胃肠炎的儿童的HAdV感染的分子流行病学情况。在COVID-19大流行之前（2018–2022年），HAdV感染的总体患病率为10.8%；而在大流行之后（2022–2023年），这一比率上升至27.7%。研究中检测到了8种HAdV基因型：F41、C1、C2、C5、C6、B3、A31和D56，其中F41是最常见的基因型。值得注意的是，通常引起流行性角结膜炎和呼吸道疾病的HAdV-D56基因型首次在患有急性胃肠炎的日本患者中被检测到。此外，HAdV-F40基因型与HAdV-F41基因型同时存在，而在之前的研究中并未发现这种情况。研究结果表明，HAdV基因型的分布，尤其是肠道型HAdV-F41，随时间发生了变化。此外，HAdV-D56在急性胃肠炎患者中的出现提示其可能与急性胃肠炎有关，因此需要在全球范围内持续监测这一病毒。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

支持本研究结果的数据可向通讯作者提出合理请求后获得。相关数据可在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/公开获取，六角体基因的高变区（HVR1-HVR6）的序列访问号为PQ424159至PQ424192，非高变区的序列访问号为PQ604850至PQ605050（涵盖所有样本）。此外，五角体基因和纤维基因的序列也分别存储在GenBank数据库中，访问号为PQ902113和PQ902114。