发现一种针对小眼症相关转录因子(MITF)的首创降解剂

《European Journal of Medicinal Chemistry Reports》:Discovery of a First-in-Class Degrader for Microphthalmia-associated Transcription Factor (MITF)

【字体: 时间:2025年11月16日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry Reports 4.1

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  MITF靶向蛋白降解剂WZS0347通过PROTAC技术有效降解MITF,抑制黑色素瘤细胞增殖迁移,机制涉及 cereblon 依赖的泛素化降解通路。

  
沈伟忠|杨汉明|陈一涵|毕书阳|刘在洲|罗凯|王振|王静|丁凯
中国科学院上海有机化学研究所化学生物学国家重点实验室,中国上海凌凌路345号,200032

摘要

微小眼症相关转录因子(MITF)在恶性黑色素瘤的发病机制、进展和药物抗性中起着核心作用。然而,由于缺乏适合传统小分子抑制的明确作用位点,MITF历来被认为是一个难以攻克的药物靶点。在这项研究中,我们发现了WZS0347,这是一种针对MITF进行降解的首创蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)。WZS0347显著降低了多种黑色素瘤细胞系(包括B16F10、A375和GAK)中的MITF蛋白水平。机制研究表明,其降解作用是通过cereblon依赖的泛素-蛋白酶体途径实现的。因此,WZS0347处理导致MITF下游靶基因的表达下调,并显著抑制了癌细胞的克隆形成和迁移能力。

章节摘录

引言

微小眼症相关转录因子(MITF)属于微小眼症(MiT/TEF)家族,具有基本的螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链(bHLH-Zip)结构域,在黑色素细胞生物学和黑色素瘤发病机制中发挥关键作用1, 2, 3, 4。MITF通过与其它bHLH-Zip家族成员(如转录因子EB(TFEB)、TFE3或TFEC)形成同源或异源二聚体来结合DNA5, 6,从而调控基因表达。其靶基因对黑色素生成至关重要,

结果与讨论

MITF PROTAC降解剂的设计。我们选择TT-012作为MITF PROTAC开发的靶结合配体(弹头),因为它具有较高的MITF结合亲和力,并且结构适合与E3 ligand结合(如图1A所示的生物素化衍生物TT-012-biotin仍保持结合亲和力)。基于这些发现,我们通过将TT-012与CRBN E3 ligase ligand通过不同的连接子连接,构建了一个针对性的PROTAC候选库(图1B)。
化学合成

结论

微小眼症相关转录因子(MITF)是黑色素瘤的潜在治疗靶点。然而,由于转录因子通常具有无序的结构,直接靶向MITF颇具挑战性。近年来,靶向蛋白降解已成为针对“难成药”靶点的一种有效策略25, 26。在本研究中,我们发现了WZS0347,这是一种首创的MITF PROTAC降解剂。WZS0347能够有效降解多种

实验部分

通用化学方法化学合成中使用的试剂和溶剂均来自商业供应商,无需进一步纯化。所有反应均通过薄层色谱(TLC)进行监测。最终化合物均通过硅胶(300-400目)柱层析进行纯化。核磁共振(NMR)谱图在Agilent DD2 500 MHz或Bruker Avance III HD 600 MHz NMR光谱仪上记录,溶剂为DMSO-d6。高分辨率质谱(HRMS)数据由Bruker提供。

CRediT作者贡献声明

王振:撰写、审稿与编辑、监督、资金获取、概念构思。丁凯:撰写、审稿与编辑、监督、资金获取、概念构思。毕书阳:验证。陈一涵:验证。杨汉明:验证、实验研究。沈伟忠:撰写初稿、验证、项目管理、实验研究。王静:撰写、审稿与编辑、监督、资金获取、概念构思。罗凯:实验研究。刘在洲:

利益冲突声明

作者声明不存在可能影响本文研究的已知财务利益或个人关系。

致谢

我们感谢国家自然科学基金(22521104)、中国科学院战略性先导科技专项(XDB1060000)以及化学生物学国家重点实验室的财政支持
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