肝毒性预测与多组学研究揭示PM2.5诱导的肝纤维化中的线粒体和脂质代谢紊乱
《Environment & Health》:Hepatotoxicity Prediction and Multi-omics Reveal Mitochondrial and Lipid Metabolic Dysregulation in PM2.5-Induced Liver Fibrosis
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年11月17日
来源:Environment & Health 6.3
编辑推荐:
PM2.5长期暴露通过代谢通路改变和ampk-sirt-cers6轴介导肝纤维化向肝癌转化,机器学习模型有效预测肝毒性风险。
本研究探讨了长期暴露于细颗粒物(PM2.5)对肝脏癌变过程(hepatocarcinogenesis)的潜在风险,并提出了一种基于机器学习的新型风险评估方法。随着环境污染对人类健康影响的日益显现,尤其是PM2.5对肝脏健康的危害,这一领域的研究变得尤为重要。肝癌是全球范围内的重大健康问题,每年导致约83万人死亡,其中肝细胞癌(HCC)占所有肝癌病例的75%至85%。肝癌的发生通常与慢性肝损伤、纤维化(FIR)以及肝硬化(CIR)密切相关。尽管已有大量研究表明空气污染与肝病发展之间存在联系,但目前缺乏一种有效的替代方法,用于评估暴露于PM2.5与肝癌发展之间的关系。传统的研究方法往往依赖于长期追踪实验和动物模型,这不仅耗时耗力,还可能受到伦理和成本的限制。因此,本研究旨在利用先进的技术手段,如质谱成像(MSI)和机器学习,建立一种新的风险评估模型,以更高效、更精准地识别PM2.5暴露对肝脏癌变的潜在影响。
在研究中,科学家们使用了小鼠模型,模拟了从纤维化到肝硬化的不同阶段,收集了肝脏组织样本,并通过质谱成像技术获取了相关数据。这些数据用于训练和验证一种多类分类模型,以识别“无风险”、“癌变风险”和“癌症”三种状态。同时,研究人员还分析了PM2.5暴露后小鼠肝脏的直接注入质谱(DI-MS)数据,进一步验证了模型的准确性。这种基于数据驱动和知识驱动的结合方法,使得研究能够识别出14种与肝病发展密切相关的生物标志物,为肝癌风险评估提供了科学依据。
PM2.5是一种直径小于2.5微米的细颗粒物,因其能够深入肺部并进入血液循环,因此对肝脏健康具有潜在威胁。研究表明,长期暴露于PM2.5可能引发肝脏纤维化,增加癌变风险。此外,PM2.5已被列为人类I类致癌物,其高浓度与肝癌发病率的显著上升有关。研究还指出,PM2.5可能通过炎症机制影响肝脏健康,进而促进肝癌的发生。通过结合代谢组学、脂质组学和转录组学等多组学分析,研究人员揭示了PM2.5暴露可能引发线粒体功能障碍、激活AMPK信号通路,并导致鞘脂(ceramide)积累,这些变化可能进一步引发胰岛素抵抗,从而促进非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和肝癌的发展。
在实验方法上,研究团队采用了多种技术手段,包括高分辨率质谱成像(DESI-MSI)和直接注入质谱(DI-MS),以获取肝脏组织中的详细代谢信息。此外,还通过LC/MS和RNA-Seq技术对代谢通路和基因表达进行了深入分析。这些方法的结合不仅提高了研究的准确性,还为理解PM2.5暴露对肝脏的影响提供了多维度的视角。例如,研究发现PM2.5暴露后,肝脏中与NAD+相关的代谢通路被显著抑制,同时线粒体功能受到损害,导致能量供应减少和AMPK信号通路的激活。这种机制可能进一步引发胰岛素抵抗和鞘脂积累,从而促进NAFLD的发展和肝癌的发生。
研究还通过机器学习模型对实验数据进行了分类和预测,结果显示,随机森林(Random Forest)模型在预测PM2.5暴露后的肝癌风险方面表现出色。该模型能够准确识别出“无风险”、“癌变风险”和“癌症”三种状态,并且在训练、验证和实际应用数据集中的表现均较为理想。此外,研究还对不同模型的预测性能进行了比较,发现决策树(DT)和梯度提升(GB)模型在训练数据集中表现良好,但在验证和实际应用数据集中的性能有所下降,这可能与模型的过拟合有关。因此,随机森林模型被认为是更优的选择。
为了进一步验证模型的预测结果,研究团队还进行了转录组学分析,通过RNA-Seq技术研究了HepG2细胞在PM2.5暴露后的基因表达变化。结果显示,与能量代谢相关的基因表达受到显著抑制,同时AMPK信号通路被激活,这可能与PM2.5暴露引发的线粒体损伤和胰岛素抵抗有关。此外,研究还发现PM2.5暴露导致了与NAFLD相关的基因表达变化,如胆固醇合成相关基因的下调和鞘脂合成相关基因的上调,这进一步支持了PM2.5在肝癌发展中的作用。
尽管本研究取得了重要进展,但仍然存在一些局限性。首先,研究中使用的小鼠模型与人体暴露情况可能存在差异,因此结果的外推需要谨慎。其次,由于样本数量有限,模型训练过程中可能存在一定的误差,尤其是在“癌变风险”分类中,部分数据可能包含非特异性信号,导致预测结果的不准确。此外,转录组学分析中,由于实验重复次数较少,基因选择的标准可能不够严格,这也可能影响研究的可靠性。未来的研究需要进一步优化实验设计,增加样本量,并结合更多的临床数据,以提高模型的准确性和适用性。
总的来说,本研究通过整合多组学数据和机器学习技术,为评估PM2.5暴露对肝脏健康的影响提供了一种新的方法。研究不仅揭示了PM2.5暴露可能引发的代谢变化和信号通路激活,还为开发更精准的肝癌风险评估模型奠定了基础。这些发现对于理解环境污染物对肝脏健康的影响具有重要意义,并可能为制定更有效的预防和干预措施提供科学依据。随着技术的不断进步,未来有望将这些研究成果应用于实际环境监测和健康风险评估,从而更好地保护公众健康。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号