人类星状病毒的分子流行病学研究以及2021–2024年间泰国急性胃肠炎患儿中HAstV4的出现

《Journal of Medical Virology》：Molecular Epidemiology of Human Astroviruses and Emergence of HAstV4 in Pediatric Patients With Acute Gastroenteritis in Thailand During 2021–2024

儿童急性胃肠炎病原星形病毒分子流行病学及遗传多样性研究（2021-2024）。泰国清迈地区1680份粪便样本检测发现星形病毒感染率2.0%，呈疫情后回升趋势（0.9%→3.2%→2.2%）。鉴定出经典人星形病毒（HAstV）及新型MLB/VA毒株共7个基因型，其中HAstV4（2024新发）和MLB2（各23.5%）占比最高。研究揭示后疫情时代星形病毒流行特征及进化动态。

　　

摘要

人类星状病毒是急性胃肠炎的重要致病病原体，尤其是在全球范围内的幼儿中。研究其分子流行病学对于监测新菌株的出现以及了解在儿童群体中传播的病毒的进化动态至关重要。在这项研究中，2021年至2024年间从泰国清迈因急性胃肠炎住院的儿童中收集了共计1680份粪便样本。通过RT-PCR技术检测星状病毒感染，随后进行核苷酸测序和系统发育分析以确定基因型并评估遗传多样性。星状病毒感染的总体患病率为2.0%（34/1680）。在COVID-19大流行之后，星状病毒感染呈上升趋势，每年的发病率分别为2021年的0.9%、2022年的1.4%、2023年的3.2%和2024年的2.2%。基因分型结果显示存在三种主要的星状病毒分支：经典人类星状病毒（HAstV）、新型MLB星状病毒和VA星状病毒，并鉴定出7种不同的基因型。HAstV1和MLB2是最主要的基因型（各占23.5%），其次是HAstV4（20.6%）、MLB1（14.7%）、HAstV5（8.8%）和VA2（5.9%）。值得注意的是，2024年出现了HAstV4的新菌株。总之，在2021年至2024年间，泰国清迈的急性胃肠炎患儿中检测到了多种星状病毒基因型。这些发现为COVID-19时代人类星状病毒的分子流行病学和遗传多样性提供了重要见解，并强调了持续监测病毒演化和疾病负担的必要性。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

本研究中报道的HAstV菌株的部分RdRp基因的核苷酸序列已存入GenBank数据库，登录号为PV838093至PV838126。代表性菌株的部分衣壳基因的核苷酸序列已存入GenBank数据库，登录号为PX378131至PX378139。