Hypostomus ancistroides复合体（Siluriformes目，Loricariidae科）两个种群中DNA甲基化的不同模式

《The Nucleus》：Different patterns of DNA methylation in two populations of the Hypostomus ancistroides complex (Siluriformes, Loricariidae)

DNA甲基化模式在具有性染色体系统（H. aff. ancistroides）和无性染色体系统（H. ancistroides）的装甲鱼类种群中存在显著差异，甲基化区域与异染色质高度重合，雄性全基因组甲基化程度更高，雌性主要甲基化于染色体末端，X/Y性染色体几乎完全甲基化，可能与异染色质形成及转座子活性相关，但鱼类甲基化与染色体互作机制仍不明确。

　　

摘要

在真核生物中，DNA甲基化仅发生在胞嘧啶残基上，并且在不同物种间呈现出不同的模式。甲基化区域通常与重复序列（如富含异染色质的区域）重合，据信这与邻近基因的沉默机制有关。本研究的目的是识别来自巴西阿尔托巴拉纳河流域的隐存物种复合体Hypostomus ancistroides的两个鱼群中的甲基化模式。其中一个种群（H. aff. ancistroides）具有性染色体系统，而另一个种群（H. ancistroides）则没有。甲基化区域的检测是通过使用抗5-甲基胞嘧啶的单克隆抗体进行免疫染色来完成的。H. ancistroides的个体显示出甲基化区域与异染色质区域之间的对应关系。而H. aff. ancistroides的个体在几乎所有染色体上都有阳性标记。此外，性别之间也存在差异：雄性个体的染色体组出现高度甲基化现象，而雌性个体的染色体上仅有少量标记，或者只有着丝粒或亚末端区域被甲基化。X染色体和Y染色体几乎完全被甲基化。这些差异的可能解释是异染色质形成过程与可移动元件（transposable elements）的存在有关。然而，尽管已有研究确定了基因组中甲基化区域的位置，但其对鱼类核型的影响及其相互作用仍不甚明了。无论如何，甲基化模式的个体差异可能反映了它们在适应过程、基因表达及每个群体进化历史中所扮演的不同角色。