Sinomonas oryzagri sp. nov.，一种从稻田土壤中分离出的促进植物生长的细菌

《Antonie van Leeuwenhoek》：Sinomonas oryzagri sp. nov., a plant-growth- promoting bacterium isolated from rice paddy soil

从水稻田土壤中分离出一株新种属的Sinomonas属菌株G460-2 T，革兰氏阳性、需氧、非运动性杆菌，最适生长条件为30℃和pH 7.0。基于16S rRNA序列的系统发育分析显示，与近缘种Sinomonas albida LC13 T的序列相似度为98.41%，但基因组学特征（如4.4 Mbp基因组、86.39% ANI值和32.0% dDDH相关度）表明其属于新物种，主要呼吸醌为MK-9(H2)，脂肪酸组成以C15:0 anteiso和C17:0 anteiso为主。

　　

摘要

从水稻田土壤中分离出一种新的Sinomonas属菌株，命名为G460-2^T。该菌株的细胞为革兰氏阳性、需氧且不具运动能力的杆状菌。其最佳生长条件为30°C和pH 7.0。基于16S rRNA基因测序的系统发育分析显示，G460-2^T菌株与 LC13^T的序列相似度最高（98.41%）。G460-2^T菌株的基因组DNA中G+C含量为68.6摩尔%。基因组大小为4.4 Mbp，与最接近的参考菌株的平均核苷酸同一性（ANI）为86.39%，低于物种划分的95%阈值。数字DNA-DNA杂交（dDDH）计算得出的最近邻菌株的亲缘关系值为32.0%。G460-2^T菌株中主要的呼吸醌为MK-9(H2)。其主要脂肪酸成分分别为C15:0 anteiso（44.8%）、C17:0 anteiso（28.7%）、C15:0 iso（11.6%）和C16:0 iso（10.1%）。