MEGA 12.1：适用于macOS和Linux操作系统的跨平台版本

《Journal of Molecular Evolution》：MEGA 12.1: Cross-Platform Release for macOS and Linux Operating Systems

MEGA 12.1 是一款跨平台演化和系统发育分析软件，新增 macOS 和 Linux 支持，优化了最大似然分析效率（通过过滤模型和自适应 Bootstrap），提升图形界面与多核性能，集成 TimeTree 数据库方便获取分子时间校准点，并实现跨系统会话文件兼容性。

　　

摘要

分子进化遗传学分析（MEGA）软件被广泛用于分子进化和系统发育分析。我们推出了MEGA 12.1版本，这是一个跨平台软件，可在macOS（Intel和Apple M系列处理器）以及现代Linux发行版上原生运行。该版本继承了MEGA 12为Microsoft Windows版本带来的所有方法学和计算方面的改进，其中包括能够显著缩短最大似然（ML）分析计算时间的技术。这些特性包括：一种筛选最佳拟合ML模型的测试方法，可以避免评估那些不太可能是最优解的衍生模型；一种自适应的谱系重建方法，能够自动确定所需的重复次数；以及对ML算法进行细粒度并行化处理，从而提升多核处理器的性能。MEGA 12.1还拥有改进的图形用户界面，支持高分辨率显示，并优化了分析进度报告和结果可视化功能。其中最显著的新增功能是改进后的“校准编辑器”，它能够与TimeTree分子分化时间数据库无缝集成，便于快速检索用于分子定年的校准点。此外，该版本还支持完整的跨平台会话文件兼容性，实现macOS、Linux和Windows之间的分析会话无缝共享。这些更新提升了MEGA在各种计算环境下的可用性、计算效率和用户体验。MEGA 12.1版本可免费下载，网址为：https://www.megasoftware.net。