比较分析显示,在两种共存的Gymnotus属(硬骨鱼纲,电鳗目)电鳗中,卫星DNA的基因组结构具有高度保守性
《Genome》:Comparative analysis reveals highly conserved satellite DNA landscapes in two sympatric Gymnotus (Teleostei, Gymnotiformes) electric knifefish
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时间:2025年11月19日
来源:Genome 1.7
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本研究通过比较基因组学分析,揭示了两种弱电鱼Gymnotus cuia和Gymnotus sylvius的卫星DNA特征,发现两者共享40个卫星DNA序列,并建立快速荧光原位杂交(qFISH)方法用于物种鉴定。
摘要
通过结合细胞遗传学和基因组分析,已经在多种生物中发现了与卫星DNA(satDNAs)相关的显著结构和进化特征。在过去的几年中,已经完成了对鱼类中卫星DNA的完整目录(即所谓的satellitomes)的鉴定。尽管在新热带鱼类中进行了比较分析,但Gymnotiformes目仍然大部分未被探索。因此,本研究旨在通过对两种带状刀鱼(Gymnotus cuia和Gymnotus sylvius)的基因组进行卫星DNA序列分析,来探讨这一目中卫星DNA的丰富程度。我们的研究在G. cuia中发现了72个卫星DNA家族,在G. sylvius中发现了66个卫星DNA家族,这两个物种的卫星DNA都具有多样的基因组扩展模式和丰富的单体成分。比较研究揭示了一个广泛共享的卫星DNA库,确定了40对物种间的卫星DNA序列对应关系,并显示了这些序列之间的相似性程度各不相同。通过对这些共有序列的染色体定位,我们得以推断出卫星DNA在Gymnotus属中的积累和分布结构动态。此外,我们还采用快速FISH技术(quick-FISH)开发了一种物种鉴定方法(GcuSat07|GSySat05),从而便于这些物种的鉴定。我们的数据表明这两种物种之间存在显著的卫星DNA共享现象,这反映了它们之间的近期分化。
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