微化石收藏的样本与数据管理：以日本新潟大学的放射虫标本为例

《Revue de Micropaléontologie》：Sample and data management of microfossil collections: case of radiolarian specimens at Niigata University, Japan

标本信息管理系统在微古生物研究中的应用与案例

　　

伊藤刚志|松冈淳

日本地质调查所地质与地理信息研究所，AIST，筑波305-8567，日本

摘要

在古生物学中，样本和标本信息的管理至关重要。对于微化石而言，由于标本数量通常较多，需要管理大量的信息。本文介绍了作者在日本新潟大学实施的放射虫标本管理案例。在该系统中，每个岩石样本都会记录采集者的姓名缩写和采集日期；每个标本条上都会分配序列号；使用行和列坐标来确定扫描电子显微镜下的标本位置；相关照片和胶片也会被赋予唯一的序列号。这种管理系统强调了可追溯性，便于对标本进行重新检查和重新拍摄。

引言

在古生物学中，样本和标本信息的管理是必不可少的。特别是在研究微化石时，需要全面的信息。微化石主要从岩石和沉积物样本中提取。一个岩石或沉积物样本可以产生大量的微化石标本（图1），这突显了有效管理所需的大量信息（表1）。微化石的研究采用了多种观察方法，如薄片观察、透射光显微镜观察和扫描电子显微镜观察。然而，本文主要关注扫描电子显微镜观察，因为这种观察方法需要大量的信息，而且作者也掌握了大部分相关材料。当使用扫描电子显微镜拍摄安装在标本条上的微化石时，必须系统地记录样本编号、标本条编号、标本在标本条上的位置以及图像文件编号。因此，编号方法对于实现可追溯性至关重要。

尽管微化石在全球范围内得到了广泛研究，但本文仅讨论日本的案例。在日本，系统化管理微化石标本的重要性已被反复强调。Ujiié（1974年）引用了海外博物馆的例子，并强调了保存微化石标本的重要性。随着20世纪80年代放射虫研究的兴起（例如Ishigaki和Yao，1982年；Suzuki和Aita，2011年；Ito等人，2020年），放射虫数据库的开发开始了，主要由名古屋大学的研究人员推动（Kojima和Mizutani，1982年；Kojima等人，1989年；Ando等人，1998年）。Saito-Kato等人（2016年）和Tuji与Suzuki（2016年）展示了微化石标本的实际应用方法。Kano（2019年）总结了岩石样本保存和参考的基本指南。然而，关于微化石收藏实际管理方法的详细描述仍然很少。

许多指南和教科书都涉及古生物学和微古生物学（例如Foote和Miler，2007年；Benton和Harper，2009年），其中许多还描述了标本提取技术（例如Armstrong和Brasier，2005年；Paris，2006年；Traverse，2007年；Jones，2011年；Saraswati和Srinivasan，2016年）。Rushton（1979年）以英国地质科学研究所的案例为基础，说明了样本和标本的编号方法。然而，很少有研究提供关于微化石收藏采样和数据管理的详细方法。即使是专门研究放射虫的书籍（例如De Wever等人，2001年；Lazarus等人，2021年）也主要描述了化石提取和标本装片技术。

第二作者松冈淳从事放射虫研究已有40多年。本文以松冈及其在新潟大学的实验室开发的放射虫数据管理方法为例，展示了微化石收藏和管理的实践。虽然不同分类群、数量和年代的微化石可能需要不同的管理方式，但这个案例仍可作为有用的参考。

章节摘录

新潟大学松冈实验室的收藏概况

松冈从事放射虫研究已有40多年，从1980年在大阪市立大学开始本科研究，一直持续到目前在新潟大学的职位。他的主要研究对象是中生代（尤其是侏罗纪）和现存的放射虫。

收藏中的标本主要是放射虫，但也包括少量的其他化石，如有孔虫、硅藻和锥形牙。

编号系统

本节介绍了用于样本、标本条、标本在标本条上的位置以及照片数字/胶片标识符的编号系统。

应用实例：样本和数据管理的应用

本文介绍的编号系统已应用于作者之前的研究中，涉及样本（例如Matsuoka等人，2005年；Ito和Matsuoka，2015年、2017年、2018年；Ito等人，2016年、2018年、2023年、2024b年）以及照片的数字/胶片标识符（例如Matsuoka，1998年、2004年、2009年；Ito等人，2024a年）。这种管理方法强调了可追溯性。使用原始照片和记录本重新拍摄了同一标本。

例如，一个

讨论与结论

在古生物学中，我们经常处理的是几年轻到几十年的标本，在某些情况下，甚至超过100年的标本。在本研究中研究的放射虫中，Haeckel和Ehrenberg描述的标本是值得注意的例子。19世纪文献中记录的标本（例如Ehrenberg，1846年；Haeckel，1860a年、1860b年、1862年、1887年）在21世纪被重新研究，研究结果于2009年发表（Tanimura和Aita，2009年）。研究小组对这些标本进行了

利益冲突声明

作者声明与本研究无关的任何利益冲突。

致谢

作者非常感谢两位匿名审稿人的宝贵意见，这些意见显著改进了本手稿的质量。