登革病毒病毒孔蛋白的计算电生理学模拟研究

《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》：Computational electrophysiology simulation study of the Dengue virus viroporins

登革病毒NS2A、NS2B和M蛋白的孔蛋白功能研究，通过文献综述和计算模拟确定孔道结构区域，结合分子动力学模拟和电生理分析揭示离子通道构象、电导特性及聚合状态，为治疗靶点开发提供依据。

　　

摘要

登革病毒是一种属于黄病毒属的虫媒病毒，是导致登革热、登革出血热和登革休克综合征的病原体，每年导致数千人死亡。本研究对三种具有孔蛋白样功能的登革病毒蛋白（NS2A、NS2B和M）进行了表征。通过全面查阅文献并运用多种计算机模拟技术，我们确定了能够形成孔道的蛋白质片段。通过独立的分子动力学（MD）模拟及模拟后的分析，并结合通道内部的水合状态研究，确定了这些孔道形成片段的潜在寡聚状态。在分析了不同寡聚拓扑结构的离子传导机制后，选出了最有可能具有离子传导能力的构象和寡聚状态。本文详细描述了这些离子通道拓扑结构及其电学特性，如导电性和通道中的电流。本研究深入阐明了这三种登革病毒蛋白的孔蛋白活性与其结构之间的关联。所收集的数据有助于针对这些蛋白进行药物干预，并为未来关于登革病毒蛋白离子通道功能的研究提供支持。