山茱萸（Cornus sanguinea L.）和丝毛山茱萸（Cornus sericea L.，属于山茱萸科）的完整叶绿体基因组序列及其系统发育关系

《Mitochondrial DNA Part A》：The complete chloroplast genome sequences and phylogenetics of Cornus sanguinea L. and Cornus sericea L. (Cornaceae)

本研究解析了 Cornus sanguinea 和 Cornus sericea 的叶绿体基因组，发现两者均具有典型四分区结构，含86个蛋白质编码基因等，系统发育分析支持其在 Cornaceae 中的近缘关系，且均无四联体等简单重复序列。

　　

摘要

本研究对属于山茱萸属（Cornus）的两种植物——Cornus sanguinea L. 和 Cornus sericea L. 的叶绿体基因组进行了全面分析。这两种植物的叶绿体都具有典型的环状四部分结构，大单拷贝区域和小单拷贝区域的长度存在轻微差异。我们完成了 C. sericea 和 C. sanguinea 的叶绿体基因组测序与分析，其基因组长度分别为 158,244 bp 和 158,663 bp。在每个叶绿体基因组中共鉴定出 131 个基因，包括 86 个蛋白质编码基因、37 个转运 RNA（tRNA）基因和 8 个核糖体 RNA（rRNA）基因。值得注意的是，这两种基因组中均不存在四核苷酸、五核苷酸或六核苷酸的简单序列重复序列。我们探讨了山茱萸科（Cornaceae）与近缘科属（如绣球花科 Hydrangeaceae、山榄科 Nyssaceae、Garryaceae、Curtisiaceae 和 Grubbiaceae）之间的系统发育关系。系统发育分析将 C. sanguinea 和 C. sericea 归入一个得到充分支持的山茱萸科分支，这与其在该科中的密切亲缘关系一致，也与以往的研究结果相符。总体而言，本研究为 C. sericea 和 C. sanguinea 的叶绿体基因组结构和特征提供了新的见解。