与骨关节炎中核苷酸代谢相关的关键基因的鉴定与验证

《Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids》：Identification and validation of key genes associated with nucleotide metabolism in osteoarthritis

骨关节炎（OA）中核苷酸代谢（NM）相关基因如AMPD3和TYMS的筛选及机制研究，通过分析GEO数据库转录组数据，结合差异表达和机器学习方法，发现 构建 nomogram 诊断模型性能优异，涉及氧化磷酸化等通路，免疫浸润与特定细胞相关，药物预测和分子对接显示AM095和脱氧尿苷酸对靶点基因强效结合。

　　

摘要

骨关节炎（OA）是一种常见的退行性关节疾病，其诊断和治疗手段较为有限。最新研究表明，核苷酸代谢（NM）在OA的进展中起着关键作用。本研究旨在识别与OA相关的NM相关基因，并探讨其潜在机制。利用GEO数据库中的转录组数据，通过差异表达分析和机器学习方法对这些基因进行了研究。通过ROC分析和临床组织样本验证，发现了两个关键基因AMPD3和TYMS。基于这两个基因构建的诺模图显示出出色的诊断性能。富集分析显示它们参与了多种生物通路，包括氧化磷酸化过程。免疫细胞浸润分析表明它们与免疫细胞存在关联。药物预测筛选出几种候选化合物；分子对接进一步证实了它们之间的强结合亲和力——AMPD3与AM095之间，TYMS与脱氧尿苷一磷酸之间。这些发现表明，AMPD3和TYMS是OA相关NM过程中的关键调控因子，有望成为新的生物标志物和治疗靶点。