导致小麦秆锈病的真菌病原体Tilletia laevis的全基因组测序

《Genomics》：Whole genome sequencing of Tilletia laevis, the fungal pathogen causing common bunt

中国小麦病害真菌秦岭剑孢子的全基因组测序完成，利用Illumina和PacBio测序技术组装出40条contig，总长38.09Mb，含10682个基因，代谢相关基因显著富集，并与近缘菌株进行比较基因组分析，为病原机制研究提供新资源。

　　

苗阳|秀明梅|小峰宇|景武|余伟强|小晓吴|韩旭吉|玉峰李|迪瑶江|晶晶徐|张驰

国家市场监督管理总局南京产品质量监督检验研究院生物毒素分析与评估重点实验室，中国南京210019

摘要

Tilletia laevis是一种真菌病原体，会导致一种称为“普通黑穗病”的严重小麦疾病，这种病害在全球小麦种植区广泛存在。然而，由于基因组数据不足，阻碍了分子水平上的研究。在这项研究中，我们利用Illumina和PacBio测序技术的整合，对中国分离出的T. laevis进行了高质量的全基因组组装。该基因组由40个contig组成，总长度为38.09 Mb，contig N50长度为1.50 Mb，最长contig长度为2.61 Mb。该基因组编码了10,682个基因，通过功能注释发现与代谢相关的基因显著富集。通过将这一基因组组装与亲缘关系密切的Tilletia菌株进行比较基因组分析，揭示了其进化轨迹。总体而言，这一基因组组装是目前最连续的T. laevis基因组，有助于未来对该病原体的致病机制和控制方法的研究。