多组学分析发现MCMBP是胰腺导管腺癌的预后生物标志物，并可能通过JAK–STAT3通路成为免疫相关的治疗靶点

《Frontiers in Immunology》：Multiomics profiling Identifies MCMBP as a prognostic biomarker and a potential immune-related target in pancreatic ductal adenocarcinoma via the JAK–STAT3 pathway

胰腺导管癌（PAAD）中MCMBP的促癌机制及其与治疗响应的关系。通过多组学分析及实验验证，发现MCMBP高表达通过激活JAK-STAT3通路促进PD-L1表达，形成免疫抑制微环境，并与不良预后显著相关。低MCMBP表达患者对PD-1/PD-L1抑制剂和吉西他滨-紫杉醇联合化疗更敏感，并鉴定了Tozasertib、Motesanib等靶向药物。

　　MCMBP，即微染色体维持蛋白结合蛋白，作为一种分子伴侣，在多种癌症中表现出异常表达，被认为是潜在的诊断标志物和治疗靶点。然而，其在胰腺导管腺癌（PAAD）中的作用尚不明确。本研究通过整合多种多组学数据资源，包括TCGA、GTEx、CPTAC、GEO、GDSC、TIDE、HPA、MethSurv、DiseaseMeth以及LinkedOmicsKB数据库，全面探讨了MCMBP在PAAD中的功能及其在免疫微环境和药物敏感性中的作用。研究结果揭示了MCMBP在PAAD中的关键作用，包括促进肿瘤进展、影响免疫逃逸以及可能的治疗策略。

在癌症研究领域，胰腺导管腺癌因其高致死率和缺乏早期检测手段而备受关注。大多数患者在确诊时已处于晚期，手术预后较差。此外，基于FOLFIRINOX方案的术前化疗常常受到化疗耐药性的限制，而这种耐药性通常由基因组不稳定性及肿瘤微环境（TME）异质性所驱动。尽管抗PD-L1免疫治疗在一些癌症类型中展现出良好前景，但其在PAAD中的效果仍受免疫微环境抑制、PD-L1表达差异以及炎症信号通路过度激活的影响。因此，识别与免疫微环境相关的预后标志物，以配合抗PD-L1治疗，可能是改善治疗效果的关键方向。

MCMBP作为一种分子伴侣，其主要功能是协助微染色体维持（MCM）复合体的组装，通过其核定位信号（NLS）和WalkerB样结构域，防止该复合体在细胞质中的降解，从而确保DNA复制的准确性及细胞周期的正常进行。MCMBP还与MCM3和MCM5亚基相互作用，以建立备用复制起点，进而维持基因组稳定性。已有研究表明，MCMBP在肝细胞癌中通过调控DNA复制和细胞周期促进肿瘤进展，在乳腺癌中与较差的生存率相关，并且在结直肠癌中与复发风险增加相关，提示其在癌症中的潜在诊断和预后价值。此外，MCMBP在增殖性B细胞中高表达，表明其可能参与免疫调节过程。尽管如此，MCMBP在PAAD中的具体作用仍未得到充分研究。

本研究通过生物信息学方法，系统分析了MCMBP在PAAD中的表达、预后意义、表观遗传调控、免疫浸润模式、免疫治疗反应及潜在治疗药物。研究团队利用TCGA、CPTAC和GEO数据库，评估了MCMBP的临床病理特征及预后价值。通过Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险模型，研究发现MCMBP的高表达与较差的预后显著相关，包括总体生存率（OS）和无进展生存率（PFI）。这些发现为MCMBP作为PAAD预后标志物提供了依据。此外，研究还构建了预测模型，将MCMBP表达、年龄、肿瘤分级和分期等独立预后因素整合为一个诺莫图（nomogram），以预测患者的生存概率。通过校准曲线、时间依赖性受试者工作特征（ROC）分析和决策曲线分析（DCA），研究进一步验证了该模型的预测性能。

在生物学功能分析方面，研究团队通过基因表达差异分析（DEGs）和功能富集分析（GO、KEGG、GSEA）揭示了MCMBP在PAAD细胞增殖、迁移、侵袭以及免疫调节中的作用。MCMBP的高表达与肿瘤微环境中的免疫细胞浸润、特别是调节性T细胞（Tregs）和M2型巨噬细胞的增加密切相关，表明MCMBP可能通过促进免疫抑制性细胞的浸润来推动肿瘤进展。此外，MCMBP还与PD-1和PD-L1等免疫检查点分子的上调相关，进一步支持其在免疫逃逸中的潜在作用。通过Western blot分析，研究确认了MCMBP在胰腺癌细胞中的表达水平，并发现其表达与PD-L1的表达呈正相关，提示MCMBP可能通过调控PD-L1的表达水平，影响T细胞的免疫应答能力。

在表观遗传调控方面，研究团队利用DiseaseMeth和TCGA数据库分析了MCMBP在肿瘤组织和正常组织中的甲基化水平。结果表明，MCMBP在肿瘤组织中的甲基化水平显著低于正常组织，且低甲基化水平与较差的预后相关。进一步的分析显示，MCMBP的表达水平与特定的m6A修饰状态密切相关，其中高表达的MCMBP与m6A“阅读者”（如IGF2BP1、IGF2BP3）和“书写者”（如VIRMA、YTHDF3）的上调相关，而低表达的MCMBP则与“擦除者”（如ALKBH5、FTO）的上调相关。这些发现表明，MCMBP的低甲基化和其相关的m6A修饰模式可能共同构成一个表观遗传特征，与PAAD的不良预后相关。

在免疫治疗反应预测方面，研究团队利用TIDE算法分析了MCMBP表达水平对免疫检查点阻断（ICB）治疗反应的影响。结果显示，MCMBP高表达的患者群体中，TIDE和排除（Exclusion）评分较高，而PD-L1评分较低，提示MCMBP可能削弱免疫治疗的效果。此外，通过IMvigor210队列数据的分析，研究团队进一步验证了MCMBP和PD-L1表达水平对患者生存率的积极影响，并发现MCMBP低表达的患者更可能对免疫治疗产生良好反应。这些结果为MCMBP作为免疫治疗预测标志物提供了支持。

在药物敏感性分析方面，研究团队整合了GDSC数据库的药物敏感性数据与MCMBP表达水平，利用oncoPredict R包计算药物敏感性评分，并通过Spearman相关性分析评估其与MCMBP表达的关联。结果显示，MCMBP高表达可能增加对某些化疗药物（如吉西他滨、紫杉醇）的敏感性，提示MCMBP可能作为预测药物反应的潜在标志物。此外，通过CMap数据库分析，研究团队筛选出了一些可能靶向MCMBP的小分子药物，包括Tozasertib、Motesanib、AMG-232、Linifanib和Filgotinib。这些药物与MCMBP的表达水平呈负相关，且在功能实验中显示出一定的治疗潜力。通过KEGG分析，研究进一步揭示了这些药物可能通过影响JAK-STAT和PD-L1信号通路，从而抑制MCMBP驱动的肿瘤进展。

在细胞实验方面，研究团队利用基因编辑技术（如shRNA）对MCMBP进行了敲低实验，并观察其对PAAD细胞增殖、迁移和侵袭的影响。结果显示，MCMBP的敲低显著抑制了细胞的增殖、迁移和侵袭能力，同时影响了细胞周期的进程，特别是G1-S期的转换。此外，MCMBP的敲低还导致上皮-间质转化（EMT）相关蛋白（如E-cadherin）的表达增加，而Vimentin和Snail的表达减少，进一步支持MCMBP在肿瘤细胞侵袭中的作用。通过免疫共培养实验，研究还发现MCMBP的敲低增强了T细胞的效应功能，表现为IFN-γ分泌的增加和STAT5磷酸化的增强，表明MCMBP可能通过抑制T细胞的激活，促进免疫逃逸。

研究团队还通过免疫组织化学（IHC）分析了MCMBP在PAAD组织中的表达情况。结果显示，MCMBP在肿瘤组织中的表达显著高于正常组织，且高表达与患者生存率下降相关。此外，MCMBP的高表达还与PD-L1的上调及CD8+ T细胞浸润的减少相关，进一步表明其在免疫逃逸中的作用。这些发现为MCMBP作为免疫治疗标志物提供了支持。

综上所述，MCMBP在PAAD中可能通过激活JAK-STAT3信号通路促进PD-L1的表达，从而导致免疫逃逸和肿瘤进展。MCMBP的高表达与较差的预后相关，并可能作为免疫治疗和化疗的潜在靶点。然而，研究仍存在一些局限性，如主要依赖于公共数据库的样本数据，缺乏直接的实验验证；此外，关于MCMBP如何通过表观遗传调控影响肿瘤进展的具体机制仍需进一步研究。未来的研究应结合体内实验，以更全面地理解MCMBP在肿瘤进展中的作用，并探索其作为治疗靶点的可行性。