检测到三个与一种澳大利亚水稻品种（Oryza sativa Kasalath）种子脱落减少行为相关的新基因位点

《Molecular Genetics and Genomics》：Detection of three novel loci involved in reduced seed-shattering behaviour of an aus rice cultivar, Oryza sativa Kasalath

水稻驯化中种子破碎减少的遗传机制研究揭示三个QTL位点（qSH1、sh4、qSH3）的作用差异，其中sh4突变在所有栽培品种中共存，而qSH1和qSH3在粳稻、籼稻和糯稻中呈现分化遗传特征，为优化育种策略提供新依据。

　　

摘要

种子脱落减少是亚洲稻（Oryza sativa）从其野生祖先O. rufipogon驯化过程中被选中的关键增产性状。据报道，有三个数量性状位点（qSH1、sh4和qSH3）与栽培稻的种子脱落减少行为有关。对这些位点的基因分型研究表明，sh4突变在所有栽培品种中都存在，而qSH1突变仅出现在某些japonica品种中。此外，qSH3突变同时存在于indica和japonica品种中；然而，aus品种在qSH3位点上携带野生稻的功能等位基因，这表明aus品种的种子脱落减少机制可能与qSH1和qSH3独立相关。通过对携带sh4位点驯化等位基因的aus品种“Kasalath”与野生稻渐渗系之间的分离群体进行遗传分析，我们发现了三个与“Kasalath”种子脱落减少行为相关的位点。后续的子代测试验证了这些位点对该性状的影响。这些发现表明，控制水稻品种种子脱落减少的遗传位点既有共性也有差异性，为理解复杂的稻米驯化过程提供了新的见解。这些知识有助于改进育种策略，通过定向遗传选择来提高产量。