贵州黑山羊产羔数插入/缺失变异的分析

《Tropical Animal Health and Production》：Analysis of insertion/deletion variation of litter size in Guizhou black goat

贵州黑山羊高、低胎量组间存在InDel遗传差异，通过全基因组重测序和选择信号分析（FST、θπ）鉴定出24个候选基因，功能富集分析显示与生殖性状相关。

　　

摘要

目的

本研究旨在探讨贵州黑山羊高产仔数（HL）组与低产仔数（LL）组之间的遗传差异，重点关注InDel变异及其与繁殖性状的潜在关联。

方法

对HL组和LL组的山羊进行了全基因组重测序，以识别InDel变异。使用F_ST和θπ进行选择信号分析，以检测可能与繁殖性能相关的位点。对这些变异进行了注释，并进行了功能富集分析。

结果

主成分分析和系统发育树构建显示，基于InDel变异，HL组和LL组之间存在明显的遗传差异。共鉴定出24个可能与产仔数相关的候选基因。功能富集分析也显示出这些基因与繁殖相关的功能。

结论

鉴定出的候选基因和富集的信号通路为理解繁殖性能的遗传基础提供了新的见解，并为山羊育种中的标记辅助选择提供了潜在的目标。