意大利梨树中首次发现柑橘病毒A（CiVA）的报道，以及对普利亚地区（意大利南部）本土梨品种的卫生状况评估

《Journal of Plant Pathology》：First report of citrus virus A (CiVA) in Italian pear trees and sanitary assessment of native pear varieties in Apulia (southern Italy)

该研究对意大利南部阿普利亚地区239份野生梨品种进行了全面病毒检测，发现苹果茎陷病毒（45.1%）、苹果叶斑病毒（33.9%）等目标病原体，并通过高通量测序（HTS）新发现柑橘病毒A（CiVA），感染率18%。该病毒本地毒株基因组首次测序完成，RNA1和RNA2序列已提交GenBank（PV665642/PV665643）。

　　

摘要

在这项研究中，对意大利南部阿普利亚地区本土梨品种（Pyrus communis L.）的种质资源进行了全面的病毒组分析。共收集了239株梨树样本，并使用逆转录PCR（RT-PCR）和逆转录定量PCR（RT-qPCR）技术对它们进行了特定病毒的检测。调查对象包括五种病毒、两种类病毒和一种植原体，这些病原体均被纳入了意大利植物繁殖材料的自愿认证标准中。两种分子生物学方法（RT-PCR和RT-qPCR）均能够检测出以下病毒：苹果茎凹陷病毒（ASPV，45.1%）、苹果叶绿斑病毒（ACLSV，33.9%）、苹果茎沟病毒（ASGV，0.4%）、苹果橡胶木病毒1型（ARWV1，2.5%）、苹果橡胶木病毒2型（ARWV2，11.7%）、梨树水疱溃疡类病毒（PBCVd，5%）以及‘Candidatus Phytoplasma pyri’（0.4%）。未检测到苹果疤痕皮类病毒（ASSVd）的阳性结果。基于这些结果，将25份对目标病原体检测呈阴性的核酸提取物进一步进行了高通量测序（HTS）分析。基于Illumina技术的高通量测序发现了柑橘病毒A（CiVA），该病毒在初步筛查中未被检测到。后续的PCR检测证实，18%的梨树样本感染了CiVA。当地CiVA分离株的完整基因组被测序，其RNA1序列长度为6,658个核苷酸，RNA2序列长度为2,721个核苷酸。这些序列已分别存入GenBank，编号为PV665642和PV665643。这是首次在意大利的梨树中发现CiVA的存在。