宫颈癌中长非编码RNA的分子生物学和生物信息学分析

《Chromosoma》：Molecular and bioinformatics analysis of long non-coding RNAs in cervical cancer

宫颈癌中LINC00518启动子低甲基化与临床病理因素及预后相关。采用MS-PCR和qRT-PCR检测81例患者，发现其低甲基化与HPV感染、年龄、组织学亚型及分化程度显著相关（p<0.001），GEPIA分析显示与总生存率相关（p<0.05），提示可能作为预后生物标志物。

　　

摘要

多种长链非编码RNA（lncRNAs）在宫颈癌（CC）的不同调控过程和治疗中发挥了重要作用。本研究旨在评估CC患者中LINC00518和MAFG-AS1基因的表达及甲基化状态。对81名患者进行了甲基化特异性PCR（MS-PCR）和定量实时PCR（qRT-PCR）检测。研究了癌组织启动子甲基化状态与HPV感染及临床病理因素之间的关联。利用GEPIA和TANRIC数据库中的Kaplan-Meier曲线分析了CC患者的总生存期。相对基因表达的生物信息学分析通过GEPIA数据库完成，并通过RNAinter数据库探讨了潜在的相互作用伙伴。这是首次研究表明LINC00518基因启动子的低甲基化可能与其在CC中的致癌行为相关（p<0.05）。然而，癌组织和正常组织中的MAFG-AS1甲基化状态之间未观察到显著差异。观察到LINC00518启动子甲基化状态与临床病理因素之间存在显著关联，包括年龄（p<0.001）、组织学亚型（p<0.00001）和分化程度（p<0.00001），这表明其可能在预测该疾病的严重程度和预后中发挥作用。总体生存分析显示，使用GEPIA分析LINC00518具有显著意义（p<0.05）。关于LINC00518在癌组织中的基因表达及其低甲基化状态的发现提示了一种可能导致其在CC中失调的机制，并可能作为潜在的临床生物标志物。