建立并表征了一种新的细胞系ICH-BCPALL-3，该细胞系来源于具有TCF3::HLF基因的B细胞前体急性淋巴细胞白血病患者

《Human Cell》：Establishment and characterization of a novel cell line ICH-BCPALL-3 from B cell precursor acute lymphoblastic leukemia with TCF3::HLF

本研究成功建立并表征了一例新型TCF3::HLF融合的BCP-ALL细胞系（ICH-BCPALL-3），其染色体核型为46,XY, der(1)(1qter→1q11::1p32→1q11::4q21→4qter), der(4)t(1;4)(q11;p32), add(8)(q24), del(17)(q24)。该细胞系携带RB1、VPREB1、NR3C1等基因缺失及AKT1扩增，经转录组学及长程PCR证实TCF3内含子16整合了HLF外显子4，且药物敏感性测试显示对Aurora激酶B抑制剂敏感而对BCL2抑制剂耐药。

　　

摘要

急性白血病的体外模型对于理解其生物学机制和开发有效治疗方法至关重要。作者建立并鉴定了一种新的细胞系ICH-BCPALL-3，该细胞系来源于B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL），能够表达TCF3::HLF融合基因。培养细胞的核型为46,XY，具有以下染色体异常：der(1)(1qter- > 1q11::1p32 > 1q11::4q21 > 4qter)、der(4)t(1;4)(q11;p32)、add(8)(q24)和del(17)(q24)。对诊断样本的分析显示存在RB1、VPREB1和NR3C1基因的缺失。该细胞系还表现出VPREB1、NR3C1和CDKN2A/2B基因的额外缺失，以及AKT1基因的扩增。PAX5和BTG1基因位点保持完整。外显子和Sanger测序技术在诊断样本中发现了ARID5B和NCOR1的核苷酸变异；在第一个复发性样本中发现了KRAS的Lys117Asn变异，在第二个复发性样本及该细胞系中发现了另一种KRAS的Asp119Gly变异。转录组分析和RT-PCR证实所有样本均含有TCF3::HLF嵌合转录本。然而，分子细胞遗传学检测未能验证TCF3和HLF基因位点的邻近关系。进一步的长距离PCR分析确认含有HLF基因4外显子的基因组片段插入到了TCF3基因的内含子16中。通过降维技术分析，我们发现该细胞系的表达模式与其他TCF3::HLF阳性的BCP-ALL细胞系相似。细胞毒性实验表明，该细胞系对Aurora Kinase B抑制剂敏感，但对BCL2抑制剂不敏感。这是首个不存在t(17;19)易位的TCF3::HLF阳性BCP-ALL细胞系模型，有助于研究白血病发生机制，并为预后不良的TCF3::HLF阳性BCP-ALL患者开发新的治疗方法。