BESTDR 实现了针对特定机制的药物反应的贝叶斯量化 开放获取

《Cancer Research》：BESTDR Enables Bayesian Quantification of Mechanism-Specific Drug Responses Open Access

药物响应动态建模与高通量筛选方法研究

　　

摘要

在细胞层面理解药物反应对于阐明作用机制和推进临床前药物开发至关重要。传统的剂量-反应模型依赖于简化的指标，这限制了它们量化细胞分裂、死亡以及细胞状态转换率等参数的能力。为了解决这些局限性，我们开发了“Bayesian Estimation of Stochastic Processes for Dose-Response”（BESTDR）框架，该框架通过纵向细胞计数数据来模拟细胞生长和治疗反应动态，从而估计浓度-反应关系。BESTDR能够利用分层建模技术，在多种细胞系中量化多状态系统中的各种速率，支持高通量筛选。通过对合成数据和实验数据集的验证，证明了BESTDR在估计药物反应方面的稳健性和准确性。通过整合细胞毒性、细胞抑制作用及其他效应的机制建模，BESTDR增强了剂量-反应研究的有效性，促进了药物之间的稳健比较以及针对特定机制的分析。BESTDR为早期临床前研究提供了强大的工具，为药物发现和基于数据的实验设计奠定了基础。