《Vaccine: X》：Epidemiology and genetic characterization of orphan polioviruses in Africa, 2022–2024: Unmasking silent transmission and implications for eradication
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本研究分析了2022-2024年WHO非洲区130例孤儿脊髓灰质炎病毒，发现Nigeria和Chad占69%，以cVDPV2为主（96%），多见于未免疫儿童，检测延迟显著，遗传多样性高，跨境传播风险突出，强调需提升监测敏感性及跨境协作。
布鲁克·特斯法耶（Brook Tesfaye）|朱利叶斯·E·奇亚（Julius E. Chia）|特纳·诺姆万格（Terna Nomhwange）|D·柯林斯·奥武尔（D. Collins Owuor）|蒂查·约翰逊·穆卢（Ticha Johnson Muluh）|萨夫达尔·诺辛（Safdar Nosheen）|阿瑟·扬尼克·杜恩莫·瓦肯（Arthur Yannick Doungmo Wakem）|阿卜杜拉蒂夫·吉莫（Abdullateef Jimoh）|阿基夫·萨特乔格鲁（Akif Saatcioglu）|凯巴·图拉伊（Kebba Touray）|阿卜杜拉希·瓦拉·哈米苏（Abdulahi Walla Hamisu）|莫杰罗姆·恩杜塔贝（Modjirom Ndoutabe）|贾马尔·A·艾哈迈德（Jamal A. Ahmed）|安富姆邦姆·克富特瓦（Anfumbom Kfutwah）
世界卫生组织非洲区域办事处区域主任办公室，脊髓灰质炎根除计划，刚果共和国布拉扎维尔
摘要
背景
持续检测到“孤儿型”脊髓灰质炎病毒（即与先前流行病毒株的VP1编码区相比，核苷酸差异≥1.5%的病毒），这对脊髓灰质炎的根除工作构成了重大挑战。这些“孤儿型”病毒的存在表明存在未被发现的传播事件和监测盲点。了解这些病毒的流行病学特征和遗传特性对于加速根除工作至关重要。
方法
本研究利用世界卫生组织（WHO）的脊髓灰质炎数据库，对2022年至2024年间在非洲地区检测到的“孤儿型”脊髓灰质炎病毒进行了回顾性分析。采用了描述性统计、空间分析和系统发育学方法来评估病毒的传播情况、遗传多样性以及监测系统的性能。
结果
在研究期间，共有130种“孤儿型”脊髓灰质炎病毒在17个国家被检测到，其中尼日利亚和乍得占了所有报告病例的69%。传播中的疫苗衍生型2型脊髓灰质炎病毒（cVDPV2）是最主要的血清型，占所有检测病例的96%。大多数“孤儿型”病毒感染者为5岁以下儿童，其中66%接种了推荐的3剂口服脊髓灰质炎疫苗（OPV）。平均检测时间为54天（四分位数范围：41–72天），在乍得和刚果民主共和国（DRC）地区检测延迟较为明显。系统发育分析显示这些病毒具有独立的起源和长期的传播特征。尼日利亚的病毒遗传多样性较高，至少存在6个不同的亚谱系，其中最主要的亚谱系为NIE-ZAS-1。在尼日利亚、乍得、尼日尔和喀麦隆发现了密切相关的病毒传播链，这表明乍得湖流域地区存在持续的跨境传播。此外，在安哥拉检测到的“孤儿型”脊髓灰质炎病毒在遗传上可追溯至尼日利亚，这表明病毒有可能进一步扩散到更广泛的地理区域。
结论
“孤儿型”脊髓灰质炎病毒的发现以及病毒之间的遗传关联表明，世界卫生组织非洲地区的监测和免疫体系仍存在漏洞。提高监测系统的灵敏度、扩大区域测序能力以及加强跨境监测和免疫活动的协调，对于及时发现隐性传播病例和推进根除目标至关重要。
