一种新型共生奈瑟菌物种携带淋病球菌的诊断标记物DR-9，会导致罗氏cobas NAAT检测出现假阳性结果

《Journal of Clinical Microbiology》：A novel commensal Neisseria species harboring the gonococcal diagnostic marker DR-9 causes false-positive Roche cobas NAAT results

淋病奈瑟菌（Neisseria gonorrhoeae）的分子诊断易受共生Neisseria属物种交叉反应干扰。本研究报告一例口腔拭子经Roche cobas CT/NG多次检测阳性但无法分离到淋病奈瑟菌的疑似治疗失败病例，最终鉴定出新型共生菌Neisseria sp. SLRRB23，其基因组携带与淋病奈瑟菌DR-9诊断靶点高度相似的序列（92%相似度），导致跨平台Roche cobas 4800/6800系统假阳性，但Aptima Combo 2（靶向16S rRNA）阴性。该菌株呈现多重抗生素耐药性（MICs值显著高于敏感标准），基因组分析发现其整合了淋病奈瑟菌DR-9区域及多个耐药相关突变（如penA、mtrR等），提示可能通过水平基因转移获得耐药基因。研究强调需优化诊断策略（如双靶点检测）并加强共生菌的耐药基因监测。

　　在全球范围内，由淋病奈瑟菌（*Neisseria gonorrhoeae*）引起的淋病仍然是一个重要的公共卫生问题。这种细菌以其高传播率和日益增强的抗生素耐药性而闻名，对公共卫生安全构成了持续威胁。尽管目前分子诊断技术已成为检测淋病奈瑟菌感染的标准手段，但其在某些情况下可能会出现假阳性结果，尤其是当样本来自非生殖道部位如口腔咽部时。这种情况可能源于与淋病奈瑟菌具有基因相似性的共生奈瑟菌种，这些细菌虽然通常无害，却可能因为基因序列的重叠而干扰诊断结果，从而影响治疗决策和抗生素使用管理。

本文描述了一种新的共生奈瑟菌株，其携带淋病奈瑟菌的诊断标记DR-9，并且在一名疑似淋病治疗失败的患者中被检测到。尽管使用了Roche cobas CT/NG测试进行初步诊断，该测试在治疗后多次显示阳性结果，但随后的确认性检测Aptima Combo 2（AC2）却显示阴性，且多次培养未能分离出淋病奈瑟菌。最终，研究人员从患者样本中分离出一种共生奈瑟菌株，并通过全基因组测序（WGS）揭示了其与淋病奈瑟菌之间的部分基因同源性。更值得注意的是，该共生菌株携带了DR-9序列，这是Roche cobas NAATs的检测目标，而AC2测试则通过靶向16S rRNA基因实现了更高的特异性。

DR-9是一种在淋病奈瑟菌基因组中高度保守的直接重复序列，用于诊断淋病奈瑟菌感染。然而，研究发现某些共生奈瑟菌种也可能携带这一序列，导致检测结果的交叉反应。这种情况在非生殖道样本中尤为常见，因为这些部位的奈瑟菌多样性较高，增加了假阳性结果的风险。研究还指出，这种交叉反应在Roche cobas 4800和6800平台上均被证实，但在AC2平台上未被检测到，这表明不同检测方法在特异性方面存在显著差异。

为了进一步探究这一现象的潜在机制，研究人员对共生菌株SLRRB23进行了全基因组测序和生物信息学分析。结果表明，该菌株与淋病奈瑟菌在基因水平上存在一定的相似性，尤其是在DR-9区域。然而，其基因组的其他部分显示出与淋病奈瑟菌的显著差异，表明该菌株可能来源于一个不同的基因组背景。此外，研究还发现该菌株在某些抗生素的最小抑菌浓度（MIC）上表现出非敏感性，提示其可能携带耐药性基因。这些耐药性基因的发现进一步强调了共生奈瑟菌种在抗生素耐药性传播中的潜在作用。

本文的研究不仅揭示了诊断技术的局限性，还突显了在分子诊断过程中进行更严格特异性检测的必要性。由于非生殖道样本中存在多种共生奈瑟菌种，且这些菌种可能携带与淋病奈瑟菌相似的基因序列，因此，仅仅依赖单一基因靶向的检测方法可能会导致误诊。这种误诊不仅影响患者的治疗效果，还可能促进抗生素耐药性的传播，对公共卫生构成威胁。因此，有必要开发更精确的检测方法，例如使用双重靶向的分子诊断技术，以减少交叉反应的可能性。

此外，研究还强调了对共生奈瑟菌种进行基因组监测的重要性。这些细菌不仅是诊断的潜在干扰源，还可能作为抗生素耐药性基因的储存库，通过水平基因转移（HGT）将耐药性基因传递给病原体。这种基因转移机制可能在多种细菌之间发生，导致耐药性在不同菌种间传播，进而增加治疗难度。因此，对共生奈瑟菌种的耐药性特征进行系统性研究，有助于理解其在耐药性传播中的作用，并为制定更有效的抗生素使用策略提供依据。

在临床实践中，针对非生殖道样本的淋病检测应更加谨慎，特别是在多次检测结果均为阳性但培养未能分离出淋病奈瑟菌的情况下。此时，应考虑进行确认性检测，以排除共生菌种的干扰。然而，目前许多检测方法并未提供明确的确认性测试选项，导致诊断过程存在不确定性。因此，开发并推广具有更高特异性的检测方法，特别是那些能够识别多个基因靶点的双重检测技术，将有助于提高诊断的准确性。

本文的研究案例也表明，即使在经过治疗后，某些患者仍可能因共生菌种的干扰而出现持续的阳性检测结果。这不仅影响了患者的治疗效果，还可能导致不必要的抗生素使用，从而加速耐药性的发展。因此，对于疑似治疗失败的病例，应考虑采用更全面的检测策略，包括培养和多重靶向的分子检测，以确保诊断的准确性。

综上所述，本文的研究揭示了共生奈瑟菌种在淋病诊断中的潜在干扰作用，并强调了提高检测特异性和加强共生菌种监测的重要性。通过进一步研究这些共生菌种的基因组成和耐药性特征，可以为开发更精确的诊断工具和优化抗生素使用策略提供重要参考。此外，研究还呼吁在临床实践中采用更严格的检测流程，特别是在处理非生殖道样本时，以减少误诊风险并防止耐药性的传播。