基因组序列分析揭示了Pseudaestuariivita属的多系性，并支持将Pseudaestuariivita rosea物种重新分类为Parasulfitobacter roseus comb.nov

《Current Microbiology》：Genome Sequence Analysis Reveals Polyphyly in the Genus Pseudaestuariivita and Supports Reclassification of the Species Pseudaestuariivita rosea as Parasulfitobacter roseus comb.nov

本研究通过基因组序列分析重新评估了Roseobacteraceae科中Pseudaestuariivita属物种的分类地位，发现Pseuda estuariivita rosea与Parasulfitobacter属的模式种Parasulfitobacter algicola亲缘关系更近，经比较氨基酸同源性（AAI）、蛋白质保守性（POCP）、基因组核苷酸平均相似性（gANI）及表型特征后，提出将其正式归类为Parasulfitobacter roseus comb. nov，解决了分类学争议并优化了Roseobacteraceae科的系统分类。

　　

摘要

基因组序列已成为客观、可靠的细菌分类学研究中不可或缺的工具。属 Pseudaestuariivita 属于 Roseobacteraceae 科。在本研究中，通过基因组序列分析重新评估了物种 Pseudaestuariivita rosea 的分类地位。基于基因组的系统发育分析表明，Pseudaestuariivita 属的物种属于多系群。具体而言，物种 Pseudaestuariivita rosea 在系统发育树上与 Parasulfitobacter 属的模式种 Parasulfitobacter algicola 形成一组，而非与 Pseudaestuariivita 属的模式种 Pseudaestuariivita atlantica 形成一组。平均氨基酸同一性（AAI）、保守蛋白百分比（POCP）、全基因组平均核苷酸同一性（gANI）、比对分数（AF）以及表型特征的比较分析显示，Pseudaestuariivita rosea 与 Parasulfitobacter algicola 之间的相似度显著高于 Pseudaestuariivita rosea 与 Pseudaestuariivita atlantica 之间的相似度。综合基因组和表型特征的证据表明，应将 Pseudaestuariivita rosea 重新分类为 Parasulfitobacter roseus 新组合（comb. nov.）。这一重新分类解决了 Pseudaestuariivita rosea 的分类学上的歧义，使其在 Roseobacteraceae 科内的分类更加一致。