U12型剪接因子ZCRB1的抑制作用有助于保留USP21内含子，从而抑制肝细胞癌的恶性进展

《Hepatology International》：Inhibition of the U12-type splicing factor ZCRB1 mediates retention of the USP21 minor intron to suppress malignant progression in hepatocellular carcinoma

RNA剪接异常在肝细胞癌（HCC）中起重要作用，但锌指CCHC型和RNA结合 motif 1（ZCRB1）在HCC中的关键功能尚未明确。本研究通过生物信息学分析、Western blotting和免疫组化证实ZCRB1在HCC组织和患者中显著高表达，且与不良预后相关。机制研究表明，ZCRB1通过调控USP21基因第11内含子保留影响剪接，抑制ZCRB1可诱导HCC细胞凋亡并抑制增殖。动物模型验证，ZCRB1靶向的GalNAc偶联siRNA能有效减少肿瘤负荷并增强CD8+ T细胞浸润。ZCRB1作为U12型剪接因子，可能成为HCC治疗新靶点和预后标志物。

　　

摘要

背景

RNA剪接失调在肝细胞癌（HCC）中起着重要作用。然而，作为小剪接体关键组分的锌指CCHC类型蛋白和RNA结合基序1（ZCRB1）在HCC中的关键功能仍不清楚。

方法

通过生物信息学分析、Western blotting和免疫组化技术评估了ZCRB1的mRNA和蛋白质表达。在体外和体内实验中研究了ZCRB1对HCC生物功能的影响。rMATS软件用于分析RNA-seq数据以识别与ZCRB1相关的可变剪接（AS）事件。在HCC小鼠模型中，使用GalNAc偶联的小干扰RNA（siRNA）对ZCRB1进行了治疗性靶向研究。

结果

我们发现ZCRB1在HCC组织中显著上调，且高水平的ZCRB1表达与HCC患者的不良预后相关。敲低ZCRB1显著降低了HCC细胞的增殖并促进了细胞凋亡。此外，启动子区域中H3K27ac的高富集水平激活了ZCRB1的表达。机制研究表明，敲低ZCRB1会导致USP21内含子11的保留，从而降低USP21的表达。USP21的过表达部分恢复了ZCRB1抑制引起的HCC细胞恶性行为的减弱，而抑制USP21则减少了HCC细胞的增殖。进一步地，在HCC小鼠模型中，使用GalNAc偶联的小干扰RNA对ZCRB1进行治疗性靶向显著降低了肿瘤负荷，并增加了CD8+ T细胞的浸润水平。

结论

本研究确定ZCRB1是一种致癌的U12型剪接因子，它通过阻止HCC细胞中USP21内含子11的保留来支持恶性生长。因此，ZCRB1可以作为HCC治疗的新靶点以及HCC预后的潜在生物标志物。

图形摘要