单细胞和空间转录组分析揭示了结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构相关的共有细胞相互作用及癌型特异性细胞相互作用，以及趋化因子信号通路

《Molecular Carcinogenesis》：Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Shared and Cancer-Type-Specific Cellular Interactions and Chemokine Signaling Associated With Tertiary Lymphoid Structures in Colorectal and Gastric Cancers

TLS在结直肠癌和胃癌中免疫微环境的单细胞和空间转录组学分析揭示了细胞亚群间相互作用网络及CXCL16-CXCR6等信号通路的作用机制。

　　

摘要

三级淋巴组织（TLS）在胃肠道恶性肿瘤中具有预后意义，并与免疫治疗反应相关，尽管其调控机制尚未完全明确。目前对TLS在单细胞水平上的理解仍然有限。在本研究中，我们将单细胞转录组学和空间转录组学技术与TLS特异性特征相结合，以绘制结直肠癌（CRC）和胃癌（GC）微环境中的空间分布和趋化因子信号通路。我们发现TLS区域中特定T细胞和巨噬细胞亚群显著富集。亚群分析揭示了不同的细胞相互作用网络：CRC中效应型CD8⁺ T细胞、耗竭型CD8⁺ T细胞、组织驻留型CD8⁺ T细胞、CD16⁺单核细胞来源的巨噬细胞、C1QC⁺巨噬细胞和SPP1⁺巨噬细胞之间存在强烈的细胞间通讯。相比之下，GC中干扰素刺激基因阳性（ISG⁺）CD8⁺ T细胞与ISG15⁺巨噬细胞之间的相互作用尤为显著。进一步分析表明，在CRC中，CD16⁺单核细胞来源的巨噬细胞可能通过CXCL16-CXCR6配体-受体对招募效应型CD8⁺ T细胞；而在GC中，ISG15⁺巨噬细胞可能利用CXCL16-CXCR6和CXCL10-CXCR3配体对招募ISG⁺效应型CD8⁺ T细胞。我们的研究揭示了TLS中具有癌症类型特异性的免疫招募机制，为理解其功能组织及潜在的治疗靶点提供了机制上的见解。

利益冲突

作者声明不存在利益冲突。

数据可用性声明

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本研究中的数据可在Gene Expression Omnibus（GEO，https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）中找到。在GEO数据库中，相关参考编号为GSE132465、GSE144735、GSE200997、GSE183904、GSE184198、GSE163558、GSE226997和GSE251950。