《Genetics in Medicine Open》:Comparative analysis reveals highly conserved satellite DNA landscapes in two sympatric
Gymnotus (Teleostei, Gymnotiformes) electric knifefish
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卫星DNA在弱电鱼类中的比较基因组学研究显示,Gymnotus cuia和Gymnotus sylvius分别含有72和66个卫星DNA家族,发现40个共有序列并建立物种鉴定方法。
Silvana Melo Sviggum | Caio Augusto Gomes Goes | Jhon Alex Dziechciarz Vidal | Rodrigo Zeni dos Santos | Maria Eduarda Gisloti-Ribeiro | Leticia Masiero Desajacomo | Manuela Candido de Mello Ferro | Claudio Oliveira | Fábio Porto-Foresti | Marcelo de Bello Cioffi | Fausto Foresti | Ricardo Utsunomia
生物科学研究所,巴西圣保罗州立大学(Unesp),Botucatu 18618-689,SP
通过结合细胞遗传学和基因组分析,已经在多种生物中发现了与卫星DNA(satDNAs)相关的重要的结构和进化特征。在过去的几年中,已经完成了多种鱼类的satDNAs目录(所谓的satellitomes)的鉴定工作。尽管对新热带地区的鱼类进行了比较分析,但Gymnotiformes目仍然大部分未被探索。因此,本研究旨在通过对两种带状刀鱼Gymnotus cuia和Gymnotus sylvius的基因组中的satDNA序列进行比较分析,来揭示这类鱼类的特征。我们的研究在G. cuia中发现了72个satDNA家族,在G. sylvius中发现了66个satDNA家族,这两种鱼类的satDNA都具有多样的基因组扩展模式和丰富的单体成分。比较研究表明,这两种鱼类共享了一个广泛的satDNA库,其中存在40对相似的satDNA序列,这些序列的相似程度各不相同。通过对这些共同序列的染色体定位,我们能够推断出satDNA在Gymnotus属鱼类中的积累和分布模式。此外,我们采用quick-FISH技术对GcuSat07|GSySat05基因进行了物种鉴定,从而简化了这些物种的识别过程。我们的数据表明这两种鱼类之间存在显著的satDNA共享现象,这反映了它们之间的近期分化。