多孔海参(Parastichopus tremulus)的基因组

《Genetics in Medicine Open》:The genome of the holothuroid Parastichopus tremulus

【字体: 时间:2025年11月21日 来源:Genetics in Medicine Open CS1.2

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  海参与Parastichopus tremulus的线粒体和核基因组测序完成,填补冷海水参基因组数据空白。线粒体基因组结构符合家族特征,核基因组总长775Mb,覆盖度24倍,BUSCO完整度87.2%。

  
罗杰·梅萨尔(Roger Meisal)|吉达·克里斯托弗森(Gyda Christophersen)
M?reforsking AS,挪威奥勒松(?lesund)
海参Parastichopus tremulus是一种重要的多孔动物物种,栖息在北大西洋东部海底区域,深度范围约为20至3000米。其地理分布范围从北部的巴伦支海延伸到南部的加那利群岛。随着人们对新型海参物种的商业兴趣日益增加,相关生物学研究也取得了进展。最近,热带海参物种的基因组数据已经公开。然而,冷水海参的基因组数据仍然缺乏。为了填补这一知识空白,研究人员对P. tremulus的线粒体基因组和核基因组进行了测序和组装。线粒体基因组的大小和基因排列结构与其他属于Stichopodidae科的多孔动物物种相似。核基因组的总长度为775 Mb,覆盖率为24倍,最终的BUSCO完整性评分为87.2%。
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