《BMC Veterinary Research》：Isolation and characterization of Salmonella enterica serovars from poultry in Egypt: a comprehensive genetic analysis of ESBLs, MCR, integron and other resistance genes
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为破解禽源沙门氏菌（Salmonella enterica）耐药基因扩散难题，作者对埃及450份样品展开耐药表型-基因型联合分析，首次报道S. Jerusalem与S. Colorado等罕见血清型携带blaTEM、blaCTX-M、mcr-1及intI1的XDR菌株，警示其在“One Health”框架下的暴发潜能。
在埃及，家禽业年产140万吨鸡肉和130亿枚鸡蛋，却长期被沙门氏菌这一“隐形盗贼”困扰。该菌可潜伏于饲料、饮水与禽舍缝隙，令鸡群出现黄绿色稀粪、肝脾肿大，却常无症状带菌，最终随鸡肉走上餐桌，全球每年因此引发13亿人次感染。更棘手的是，农场为促生长或治病滥用抗菌药，把禽舍变成了耐药基因“演武场”——β-内酰胺酶（ESBLs）、AmpC、金属酶（MBLs）乃至“最后底牌”黏菌素（colistin）耐药基因mcr-1陆续登场。面对耐药率攀升却缺乏血清型与基因全景数据的尴尬，Mona Salem等人在《BMC Veterinary Research》发表研究，系统扫描埃及肉鸡源沙门氏菌的“身份—耐药—基因”三维图谱，为阻断人兽共患病原的扩散提供关键情报。
作者于2024年2–4月自曼苏拉等地收集450份临床健康、发病及刚死亡白羽与Sasso肉鸡（1–50日龄）的泄殖腔拭子、卵黄囊与肝等内脏，经BPW/RV增菌、XLD/MacConkey分离，结合革兰染色、生化与invA基因PCR，确诊29株沙门氏菌，总体分离率6.44%。随后采用Kauffmann–White血清玻片凝集、微量肉汤稀释（BMD）测定黏菌素MIC，并用CLSI 2024纸片扩散判定22种药物敏感性；最后以PCR与测序筛查ESBL、AmpC、MBL、mcr-1至mcr-9及Ⅰ类整合子intI1等基因，结合χ2与Spearman分析耐药基因共现规律。
结果
1. 流行率与分子鉴定
29株全部invA阳性，病禽分离率最高（8%），69%源于内脏，提示发病阶段菌载量高、易播散。
2. 血清型分布
鉴定出8种血清型，S. Kentucky（34.5%）与S. Derby（20.7%）占主导，且首次在埃及禽源报道S. Colorado（6.9%）与S. Jerusalem（3.5%），后者曾在欧洲有机豆粕相关疫情中出现，暗示进口饲料或祖代鸡群引入新谱系。
3. 耐药表型
所有菌株对头孢西丁、头孢吡肟、头孢他啶、萘啶酸、红霉素和磷霉素100%耐药；对阿米卡星、亚胺培南、美罗培南的敏感率分别为37.9%、65.5%、96.6%。75.9%菌株呈广泛耐药（XDR），仅对1–2类药敏感；多重耐药指数（MAR）0.6–0.9，远超0.2的高风险阈值，表明农场抗菌药压力巨大。
4. 黏菌素耐药
BMD测得8株（27.6%）MIC >2 mg/L，均被判定耐药，提示“最后防线”已出现缺口。
5. 耐药基因谱
blaTEM检出率82.8%，blaOXA-10、blaSHV、blaCTX-M各约24–28%，blaCMY-2与blaOXA-2分别占10.3%与3.4%，未检到blaVEB-1及任何碳青霉烯酶基因；mcr-1阳性率10.3%，其余mcr亚型为零；Ⅰ类整合子intI1高达96.6%。基因共现分析显示blaCTX-M与mcr-1、blaCMY-2呈强相关（ρ≥0.60），提示其可能共存于可接合质粒，在β-内酰胺与黏菌素双重选择下加速固定。
6. 系统发育
invA、blaTEM、blaCTX-M、mcr-1与intI1序列与全球人源、猪源和禽源沙门氏菌参考株同源性100%，证实耐药基因跨国、跨宿主广泛传播。
结论与讨论
研究首次揭示埃及肉鸡同时藏匿罕见血清型与“全明星”耐药基因：S. Jerusalem携带blaTEM-blaSHV-blaCTX-M-mcr-1-intI1，S. Colorado亦呈XDR，且耐药表型与基因型分布不受血清型限制，表明水平转移比克隆扩散更关键。高频率intI1为多重耐药盒式捕获提供“分子脚手架”，而mcr-1与ESBL共定位意味着即便停用黏菌素，共选择仍可维持其流行。27.6%黏菌素耐药率与96.6%整合子阳性率均高于既往埃及报道，提示耐药态势仍在恶化。作者强调，若这些XDR菌株沿食物链侵入人群，将导致治疗选择受限、住院时间延长与死亡率上升，对儿童、老人及免疫低下者尤为危险。为此，必须立即启动国家层面“One Health”监测，对饲料、祖代鸡与零售肉进行全基因组追踪；在农场端推行处方制、休药期与生物安全清单，严禁把黏菌素、磷霉素等“人用底牌”当常规预防药；同时保留美罗培南等碳青霉烯类作为人类最后选项，并加快研发快速检测盒与疫苗，从源头阻断沙门氏菌的“埃及之路”。
