2型糖尿病的药物再利用:基于DrugBank数据库的潜在α-葡萄糖苷酶抑制剂的计算研究

《In Silico Pharmacology》:Drug repurposing for type 2 diabetes: computational studies of potential alpha-glucosidase inhibitors from DrugBank

【字体: 时间:2025年11月22日 来源:In Silico Pharmacology

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  2型糖尿病的α-葡萄糖苷酶抑制剂研究通过分子对接筛选和分子动力学模拟,发现 sisomicin 结合稳定且活性最佳,为药物重定位提供新候选。

  

摘要

2型糖尿病是一种普遍存在的疾病,持续对全球健康造成重大负担。尽管已有多种药物可用于治疗该疾病,但其发病率和死亡率仍持续上升。α-葡萄糖苷酶抑制已成为预防餐后高血糖的一种有前景的治疗策略。药物发现的一种方法是药物再利用,即研究现有药物的新治疗用途。本研究采用三阶段分子对接方法,从DrugBank数据库中筛选针对N端麦芽糖酶葡糖淀粉酶(ntMGAM)靶点的潜在α-葡萄糖苷酶抑制剂。我们选择了10种对接性能最佳的化合物,并通过MMGBSA计算重新评估这些化合物,结果发现arbekacin、neamine和sisomicin的结合自由能分别为-72.13、-55.14和-69.07 kcal/mol,这三种化合物位列前三。随后,我们使用分子动力学模拟(MDS)方法分析了这些化合物与标准药物阿卡波糖的蛋白质结合稳定性。MDS分析表明,sisomicin与α-葡萄糖苷酶的相互作用最为稳定,其结合自由能也最强。这些发现表明,sisomicin是一种潜在的α-葡萄糖苷酶抑制剂,是用于抗糖尿病治疗的新型药物再利用候选物。

2型糖尿病是一种普遍存在的疾病,持续对全球健康造成重大负担。尽管已有多种药物可用于治疗该疾病,但其发病率和死亡率仍持续上升。α-葡萄糖苷酶抑制已成为预防餐后高血糖的一种有前景的治疗策略。药物发现的一种方法是药物再利用,即研究现有药物的新治疗用途。本研究采用三阶段分子对接方法,从DrugBank数据库中筛选针对N端麦芽糖酶葡糖淀粉酶(ntMGAM)靶点的潜在α-葡萄糖苷酶抑制剂。我们选择了10种对接性能最佳的化合物,并通过MMGBSA计算重新评估这些化合物,结果发现arbekacin、neamine和sisomicin的结合自由能分别为-72.13、-55.14和-69.07 kcal/mol,这三种化合物位列前三。随后,我们使用分子动力学模拟(MDS)方法分析了这些化合物与标准药物阿卡波糖的蛋白质结合稳定性。MDS分析表明,sisomicin与α-葡萄糖苷酶的相互作用最为稳定,其结合自由能也最强。这些发现表明,sisomicin是一种潜在的α-葡萄糖苷酶抑制剂,是用于抗糖尿病治疗的新型药物再利用候选物。

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