血浆分级分离与混合物处理可提升蛋白质组学分析的覆盖范围

《Journal of Responsible Technology》：Plasma Fractionation and Mixture Improves Coverage in Proteomic Analysis

血浆蛋白组学扩大覆盖策略研究中，采用乙腈梯度沉淀（10%、20%、40%、50%浓度）结合聚乙二醇沉淀和白蛋白去除，构建混合样本（含10%全血浆、20%20%AcN沉淀、10%40%AcN沉淀、20%50%AcN上清及PEG沉淀去白蛋白样本）。该策略成功鉴定5441个血浆蛋白，较直接检测全血浆的2040个蛋白数量显著提升，为建立更大规模血浆蛋白组学数据集提供有效方法。

　　

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中国江苏省南京市南京医科大学临床学院南京鼓楼医院实验医学系，邮编210008

扩大血浆蛋白质组的覆盖范围有助于提高发现血液生物标志物的成功率。本文报道了通过逐步增加乙腈（AcN）浓度对血浆进行沉淀的方法来分离蛋白质。将其中一些分离得到的组分与通过聚乙二醇（PEG）沉淀和白蛋白去除法得到的其他组分混合，得到了如下组成的混合样本：10%全血浆、20% 20%-AcN沉淀物、10% 40%-AcN沉淀物、20% 50%-AcN上清液、20% 10%-PEG沉淀-白蛋白去除物以及20% 20%-PEG沉淀-白蛋白去除物。通过这种方法共鉴定出5441种蛋白质，这一数量远高于直接从全血浆中检测到的2040种蛋白质。本研究提供了迄今为止规模最大的血浆蛋白质组数据集，并推荐这种分离和混合策略作为扩大血浆蛋白质组覆盖范围的有效方法。