《Tuberculosis》：First Confirmation of
Mycobacterium tuberculosis Complex from Medieval Ireland by aDNA Analysis – Palaeopathological and Microbial Findings.
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通过古DNA分析确认爱尔兰拉内拉赫遗址8具骨骼中5例为结核分枝杆菌感染，首次在爱尔兰考古个体中发现结核病病原体，排除了布鲁氏菌病可能。
Eileen M. Murphy | G. Michael Taylor | Tom A. Mendum | Graham R. Stewart
贝尔法斯特女王大学自然与建筑环境学院考古学与古生态学系，北爱尔兰贝尔法斯特BT7 1NN
摘要。
对爱尔兰罗斯康芒镇附近Ranelagh多时期农村定居点中的八具遗骸进行了古DNA（aDNA）检测，这些遗骸显示出疑似骨骼结核病或布鲁氏菌病的病理病变。在五名个体中确认了结核病感染（MTB复合DNA）：一名11至13世纪的青少年女性（14.5-17.5岁）、两名20至35岁的年轻成年女性（7至10世纪）、一名性别不明的青少年以及一名35至50岁的中年成人（中世纪时期）。后一例的鉴别诊断包括布鲁氏菌病，因为其下脊柱椎骨存在多灶性溶解性病变。然而，该个体及所有受检样本的布鲁氏菌属DNA检测结果均为阴性。在两名阳性样本中，从牙髓腔提取物中检测到了4系（欧美型）结核分枝杆菌DNA。这是首次通过aDNA分析确认爱尔兰古代个体患有结核病。
章节摘录
引言
结核病是一种由结核分枝杆菌复合群（MTB）引起的慢性肉芽肿性传染病，可累及多个身体系统，对当今全球人口构成重大健康威胁[1]。历史资料表明，结核病在爱尔兰曾是一个严重问题，在17世纪至20世纪中叶的死亡率统计中尤为突出[2, 3]。此前已有研究观察到与骨骼结核病相关的病变特征[4]。
保存状况
遗骸的完整性程度、碎片数量以及侵蚀/磨损情况均按照McKinley（1994）的方法进行了记录[17]。死亡年龄——青少年
青少年的死亡年龄是通过标准骨骼学方法估算的，包括长骨骨干长度、颅骨测量数据[18, 19, 20, 21, 22]、骨骺融合情况[23]以及牙齿发育和萌出情况[24]。牙齿发育被认为较不易受到影响骨骼生长的环境因素的影响[25, 26]。
骨骼学
每个个体病变的详细描述和图像见补充材料。表2总结了各骨架中病变的分布情况。九名受影响的个体包括五名女性、一名男性和两名青少年（Sk. 274、Sk. 291）以及一名性别不明的幼童（Sk. 273）。男性（Sk. 424）为中年人，女性包括一名中年人（Sk. 399）和三名年轻成年人（Sk. ……）。
讨论
我们对爱尔兰罗斯康芒郡Ranelagh考古遗址中的八具遗骸进行了检查，这些遗骸显示出结核病或布鲁氏菌病的迹象，旨在确认病原体DNA的存在并区分这两种疾病。尽管其中三名个体（Sk. 18、Sk. 293、Sk. 399）的椎骨病变具有非典型特征，可能提示布鲁氏菌病，但在其中两名个体（Sk. 18或Sk. 399）中未检测到布鲁氏菌属DNA。结论
在罗斯康芒郡Ranelagh遗址的五例中检测到结核分枝杆菌DNA具有重大意义，这是首次成功提取到结核病DNA，从而在中世纪爱尔兰古代个体中确诊结核病。这些中世纪爱尔兰菌株被鉴定为4系（欧美型），属于“现代”菌株，这与我们从英国获得的有限信息相符。目前仅有限类型的基因分型数据。作者贡献声明
Tom A. Mendum：撰写、审稿与编辑、资源整理、方法学研究、调查工作。Graham R. Stewart：撰写、审稿与编辑、资源整理。Eileen M. Murphy：撰写、审稿与编辑、初稿撰写、数据可视化、资源管理、方法学研究、调查工作、资金申请、数据分析、数据管理、概念构建。G. Michael Taylor：撰写、审稿与编辑、初稿撰写、数据可视化、资源整理、方法学研究、调查工作、正式报告撰写。利益冲突声明
? 作者声明不存在可能影响本文研究的已知财务利益或个人关系。致谢
我们感谢Shane Delaney（IAC有限公司）负责Ranelagh遗址的发掘工作，以及Martin Jones（爱尔兰交通基础设施部门）对发掘及后续分析的监督。同时感谢Ranelagh骨考古团队的成员——Deirdre Drain博士、Jeanna Loyer博士、Sarah Gormley、Grace McAlister、Lauren Halstead、Roisin O’Reilly博士、Jessica White博士和Lisa White——她们参与了遗址人类遗骸的初步检查工作。
