基于数据驱动的Aβ靶向抗体数学模型优化阿尔茨海默病治疗策略

《npj Systems Biology and Applications》:Data-driven modeling of amyloid-β targeted antibodies for Alzheimer’s disease

【字体: 时间:2025年11月22日 来源:npj Systems Biology and Applications 3.5

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  本文推荐研究人员针对阿尔茨海默病(Aβ)治疗中单克隆抗体疗效与副作用(如淀粉样蛋白相关影像学异常ARIA)难以平衡的问题,开展了Aβ聚集动力学数学模型研究。通过建立涵盖单体到纤维全过程的常微分方程体系,结合参数估计与最优控制理论,发现Donanemab单药治疗可降低85%以上纤维负荷,联合用药策略可进一步提升至87%。该研究为个性化AD治疗提供了定量优化框架。

  
当谈及阿尔茨海默病,人们往往会联想到记忆的逐渐流失和认知功能的衰退。这种神经退行性疾病的背后,是大脑中淀粉样蛋白β(Aβ)的异常聚集,形成毒性寡聚体(toxic oligomers)和纤维状斑块。尽管科学界已开发出Aducanumab、Donanemab和Lecanemab等单克隆抗体药物,但如何平衡治疗效果与副作用(如淀粉样蛋白相关影像学异常ARIA)仍是临床面临的严峻挑战。现有模型多关注晚期斑块形成阶段,却忽视了从单体到纤维的完整聚集动力学过程,特别是对早期毒性寡聚体的靶向干预策略缺乏定量评估工具。
针对这一瓶颈,发表于《npj Systems Biology and Applications》的研究团队构建了一个创新的数学模型框架,首次完整捕捉了Aβ从单体(M)、二聚体(D)、三聚体(T)到原纤维(P)、高分子量寡聚体(N)和成熟纤维(F)的动态转化过程。通过质量作用动力学和粗粒度建模方法,该模型将复杂的生物化学过程转化为可量化的数学方程。研究团队采用Sobol敏感性分析筛选出19个关键参数中的核心调控因子,并利用体外实验数据对模型进行严格校准。尤为重要的是,他们引入最优控制理论,将药物治疗抽象为时间依赖的控制函数,在最大化降低纤维和毒性寡聚体的同时,将ARIA风险纳入目标函数进行协同优化。
关键技术方法包括:建立涵盖6种Aβ物种的常微分方程组;采用Sobol全局敏感性分析识别关键参数;基于Nelder-Mead优化算法的参数估计技术;结合临床ARIA-E发生率数据构建剂量依赖性副作用函数;应用Pontryagin极大值原理求解多药物协同最优控制问题。实验数据来源于已发表的Aβ42肽体外聚集动力学测量结果(ThT荧光法),涵盖1.1-5μM共10个初始单体浓度。
参数估计
通过文献调研和稳态分析,研究人员确定了19个关键参数的取值范围,包括反应速率、清除率和饱和值等。其中二聚体形成速率k12为800-1180 M-1s-1,单体清除率μ1为10-5-10-3 s-1。对初始单体浓度M(0)>2μM和≤2μM两种情况分别确定了不同的参数可行域,确保模型在不同生理条件下的适应性。
敏感性分析
Sobol敏感性分析显示,参数K2(三聚体饱和值)对纤维动力学影响最大,总敏感性指数达0.781。而ε1(三聚体向单体转化速率)和μ5(高分子量寡聚体清除率)等参数敏感性较低,表明其对模型输出影响有限。分析结果在不同样本量(N=24到220)下均保持稳定,证实了模型的鲁棒性。
数据驱动建模
利用实验测得的纤维形成动力学数据,研究团队通过参数可辨识性分析将参数分为可辨识与不可辨识两类。对不可辨识参数引入正则化处理,获得稳定可靠的参数估计值。不确定性量化分析显示,模型在95%置信区间内能较好地捕捉实验观测趋势,但在低单体浓度下对纤维形成滞后期的预测存在偏差,可能与未考虑次级成核反馈机制有关。
抗Aβ治疗的最优控制研究
治疗方案优化结果显示,Donanemab单药治疗可使纤维负荷降低85.7%-86.1%,显著优于Lecanemab(15.5%-24.9%)和Aducanumab(12.1%-27.0%)。联合用药策略中,"全部药物"组合效果最佳,纤维降低率达87.1%-89.4%。值得注意的是,联合治疗时各药物的控制函数呈现时序协同:Donanemab保持早期强效干预,而Lecanemab和Aducanumab的峰值强度相对延迟,体现治疗资源的优化分配。
副作用评估方面,模型基于临床试验数据构建了ARIA-E发生率与剂量的线性关系:Donanemab为0.221uD/UmaxD,Lecanemab为0.0563uL/UmaxL,Aducanumab为0.301uA/UmaxA。通过将副作用项纳入目标函数,模型实现了疗效与安全性的定量平衡。
研究结论表明,该数学模型框架首次实现了Aβ聚集全过程的动态模拟与治疗优化。通过将生物物理原理与临床数据融合,为个体化AD治疗提供了可靠的计算工具。Donanemab在单药治疗中的卓越表现与其对纤维状斑块的高选择性一致,而联合治疗的协同效应提示不同作用机制药物的互补价值。未来工作可拓展至tau蛋白、神经炎症等多靶点调控,并将此建模框架应用于其他蛋白构象疾病的研究中。
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